پديد آورنده :
السمسار، حيدر
عنوان :
بررسي تنوع ژنتيكي ويروس سپتي سمي هموراژيك(Viral haemorrhagic septicaemia virus (VHSV در مزارع پرورش ماهيان قزل آلاي رنگين كمان (Oncorhynchus mykiss) در ايران
مقطع تحصيلي :
كارشناسي ارشد
گرايش تحصيلي :
بيوتكنولوژي
محل تحصيل :
اصفهان: دانشگاه صنعتي اصفهان، دانشكده كشاورزي
صفحه شمار :
يازده، 68ص.: مصور، جدول، نمودار
يادداشت :
ص. ع. به فارسي و انگليسي
استاد راهنما :
مجيد طالبي، اميرحسين جلالي
توصيفگر ها :
بيماري سپتي سمي هموراژيك ويروسي , قزل آلا , تنوع ژنتيكي- RT-PCR , ايران
استاد داور :
مسعود بهار، امير مساح
تاريخ ورود اطلاعات :
1396/01/21
چكيده فارسي :
0 چكيده بيماري سپتيسمي هموراژيك ويروسي Viral haemorrhagic septicaemia VHS مسبب آن ويروس VHSV از خانواده rhabdoviridae رابدوويريده است و يكي از مشكالت مهم مزارع پرورش ماهي قزل آال در جهان ميباشد در سالهاي اخير موارد مشكوك به اين بيماري در مزارع پرورشي ايران نيز مشاهده شده است به منظور بررسي شيوع و تنوع ژنتيكي VHSV در ايران از 00 استان واقع در شمال جنوب غرب غرب و مركز ايران 99 مزرعه نمونهگيري شد به كمك روش RT PCR و تكثير قسمتي از ژن نوكلئوپروتين 111bp N نمونههاي مثبت تعيين شدند در مرحله بعد قطعات ژني تكثير يافته توالييابي شدند و درنهايت براي رسم درخت فيلوژنتيك مورد استفاده قرارگرفتند به منظور بررسي ارتباط ژنتيكي سويههاي جدا شده تواليهاي بدست آمده در اين تحقيق با توالي 820 سويه موجود در بانك ژن به نمايندگي از چهار ژنوتيپ شناخته شده از VHSV همرديف سازي شدند درصد شيوع اين بيماري در مزارع نمونهگيري شده 02 02 محاسبه شد نتايج نشان داد در سه جايگاه تنوع توالي وجود دارد كه يك جهش از نوع دگرمعني و دو جهش خاموش است تجزيه و تحليل فيلوژنتيك تواليهاي نوكلئوتيدي نشان داد كه تمام سويههاي VHSV مورد مطالعه در اين تحقيق به سويههاي ويروسي آب شيرين دانمارك و آلمان نزديكتر هستند و در ژنوتيپ I تحتدودمان Ia قرار ميگيرند اين يافتـه نشان مي دهد سويههاي ويروسي VHSV ايران منشأ اروپايي دارد واژههاي كليدي بيماري سپتيسمي هموراژيك ويروسي قزل آال تنوع ژنتيكي RT PCR ايران
چكيده انگليسي :
72 Genetic Diversity of the Viral haemorrhagic septicaemia virus VHSV in Rainbow Trout Oncorhynchus mykiss in Iran Hayder Al simsar h alsemsar@ag iur ac ir January 15 2017 Department of Agricultural Biotechnology Isfahan University of Technology Isfahan 84156 83111 IranDegree M Sc Language FarsiSupervisors M Talebi mtalebi@cc iut ac ir S A H Jalali sahjalali@cc iut ac irAbstractViral haemorrhagic septicaemia VHS caused by the rhabdovirus VHSV is the most economically importantviral disease in the world rainbow trout farming In recent years suspected cases of this disease have beenobserved in Iran rainbow trout farms To evaluate the outbreak and genetic diversity of VHSV sampling wasperformed from the 11 provinces 33 farms in North South West West and center of Iran Positive sampleswere determined using RT PCR method and amplification of the partial nucleoprotein N gene 505 bp Inthe next step amplified gene fragments were sequenced and eventually used to build phylogenetic tree Thesesequences were analyzed to evaluate their genetic relationship with 128 isolates from Genbank representingthe four known genogroups of VHSV The prevalence of disease in the sampling farms was 21 21 Theresults showed sequence variation in three codon positions one mutation was missense and two were silent Phylogenetic analysis by nucleotide sequences showed that all the VHSV isolates in this study were closestrelated to the fresh water strains from Denmark and Germany and grouped in genotype I sublineage Ia Thisfinding indicates that Iranian VHSV isolates have a European origin Keywords Viral hemorrhagic septicemia Rainbow trout Genetic diversity RT PCR Iran
استاد راهنما :
مجيد طالبي، اميرحسين جلالي
استاد داور :
مسعود بهار، امير مساح
