12787

11702

كارشناسي ارشد

بيوتكنولوژي

اصفهان: دانشگاه صنعتي اصفهان، دانشكده كشاورزي

1396

يازده، 97ص.: مصور، جدول، نقشه، نمودار

ص.ع. به فارسي و انگليسي

مجيد طالبي، اميرحسين جلالي

بدرالدين ابراهيم سيد طباطبايي، امير مساح

1396/06/21

كتابنامه

كشاورزي

مهندسي كشاورزي

ID11702

91 چكيده نكروز عفوني مراكز خون ساز IHN يكي از مهمترين بيماريهاي ماهيهاي قزلآال و سالمون به خصوص انواع با اهميت اقت صادي باال مانند قزل آالي رنگين كمان و ساااالمون چينوس اسااات تلفات تجمعي بيماري به بيش از 09 درصاااد ميرساااد عامل بيماري يك Rhabdovirus از جنس Novirhabdovirus به نام ويروس نكروز عفوني مراكز خونسااااز IHNV اسااات هدف از اين مطالعه ارزيابي شيوع و تنوع ژنتيكي ويروس IHNV در مزارع پرورش قزلآالي رنگينكمان بر اساس توالي قسمتي از ژن G ويروس ميباشد تا بدين و سيله بتوان من شا ا صلي ويروس و الگوي پراكنش آن در ك شور را برر سي نمود از زم ستان 2931 تا تاب ستان 4931 33 مزرعه مشكوس از 11 استان مهم پرورش ماهي قزلآالي رنگين كمان مورد نمونهگيري قرار گرفتند مطابق دستورالعمل سازمان جهاني بهداشت حيوانات قلب طحال و كليه قدامي به صورت نيمه سترون جدا گرديده و بالفاصله در محلول RNAlater محصول شركت Qiagen غوطهور شادند اساتخراج RNA با كيت اساتخراج RNA محصاول شاركت Qiagen و مطابق با دساتورالعمل توليدكننده انجام شاد ا ا ا ا ا ا ا cDNA با اسااتفاده از كيت ساااخت شااركت Fermertas ساااخته شااد واكنش PCR به كمك كيت JenetBio انجام گرفت قطعه 693bp تكثيري به كمك الكتروفورز شاااناساااايي شاااده با روش خاتمه زنجيره توالي يابي گرديد آناليز فيلوژنتيك با نرم افزار ClC Genomic Workbench و با اسااتفاده از پايگاه داده NCBI انجام گرديد اين مطالعه نشااان داد از ميان 5 اسااتان آلوده به IHNV اسااتان چهارمحال و بختياري پيشااترين ميزان شاايوع بيماري را دارد و شاايوع كل در مزارع پرورش قزلآالي رنگين كمان ايران 81 81 اندازهگيري شاااد جدايه هاي ايراني تنها در دو جايگاه نوكلئوتيدي اختالف نشاااان دادند جدايهي 39 IHNV با يك جدايه ايتاليايي شناسايي شده در سال 5102 مطابقت كامل داشت و مربوط به ژنوگروپ E بود كه در اروپا شايع ميباشد با توجه به يكسان بودن جدايه هاي هر ساااال به نظر ميرساااد ساااويه جديد 39 IHNV در ساااال 5102 از ايتاليا وارد كشاااور شاااده و جايگزين ساااويه غالب قبلي 29 IHNV گرديده است كلمات كليدي IHNV ويروس نكروز عفوني مراكز خونساز قزلآالي رنگين كمان تنوع ژنتيكي فيلوژنتيك

Genetic Diversity of Infectious Haematopoietic Necrosis Virus IHNV in Rainbow Trout Oncorhynchus mykiss in Iran Mohamad Hassan Latifian mhlatifian@yahoo com June 20 2015 Department of Biotechnology Isfahan University of Technology Isfahan 84156 83111 IranDegree M Sc Language FarsiSupervisors M Talebi mtalebi@cc iut ac ir A H Jalali sahjalali@cc iut ac irAbstractInfectious hematopoietic necrosis IHN is one of the most serious fish diseases in salmon and trout includingeconomically important species like rainbow trout Oncorhynchus mykiss chinook Oncorhynchus tshawytscha sockeye Oncorhynchus nerka and others IHN outbreaks may occur on farms rearing fry or juvenile rainbow trout infresh water and cumulative mortality may reach 90 or more depending on the fish species and size virus strain andenvironmental conditions The causative agent of IHN is a Rhabdovirus of the genus Novirhabdovirus known asInfectious hematopoietic necrosis virus IHNV The aim of this study is to evaluate the prevalence and geneticdiversity of IHNV based on the partial G gene in order to evaluate genetic relatedness to representative strains andreveal the origin of current strain and prevalence of diseases From December 2013 to July 2015 11 major rainbowtrout culture provinces surveyed and 33 suspected farms were selected for sampling According to OIE protocol anterior kidney spleen and heart dissected and immediately fixed using the RNAlater kit Qiagen RNA extractionwas performed using the Qiagen kit according to manufacturer protocol cDNA synthesis and polymerase chainreaction carried out by Frmentas and JenetBio kits respectively Size band 693bp characterized using gelelectrophoresis and sequenced by Sanger method Phylogenetic analysis carried out by CLC Genomic Workbenchsoftware and NCBI database This study showed Chahar Mahaal Va Bakhtiari has the highest prevalence of IHNVamong 5 infected provinces and average prevalence in Iranian rainbow trout farms was 18 18 Iranian isolates differonly in two SNPs and one of isolates IHNV93 was completely identical to Italian isolate in 2015 and belong to EGenogroup According to the identity of isolates of the same year it seems in 2015 new isolate IHNV93 importedfrom Italy and replaced from previous prevailing IHNV isolate IHNV92 Keywords IHNV rainbow trout Oncorhynchus mykiss Genetic diversity Phylogenetics

مجيد طالبي، اميرحسين جلالي

بدرالدين ابراهيم سيد طباطبايي، امير مساح