12917

11815

كارشناسي ارشد

تكثير و پرورش آبزيان

اصفهان: دانشگاه صنعتي اصفهان، دانشكده منابع طبيعي

1396

يازده، 68ص.: مصور، جدول، نقشه، نمودار

ص.ع. به فارسي و انگليسي

سالار درافشان

سجاد نظري

اميدوار فرهاديان، منصوره ملكيان

1396/07/29

كتابنامه

منابع طبيعي

مهندسي منابع طبيعي

ID11815

2 چكيده در مطالعهي حاضر تنوع ژنتيكي قزلآلاي رنگينكمان Oncorhynchus mykiss با نمونهبرداري 05 قطعه از مولدين موجود در هشت مزرعه استانهاي تهران چهارمحال و بختياري كهگيلويه و بويراحمد فارس آذربايجان غربي لرستان قزوين و مازندران با استفاده از توالييابي ناحيه كنترلي D loop ژنوم ميتوكندريايي بررسي شد قطعه ناحيه كنترل در طول باند 766 bp با استفاده از يك جفت آغازگر اختصاصي تكثير شد 55 نمونه از 05 نمونه در طول قطعه 481 bp توالييابي شدند درخت فيلوژنتيكي با استفاده از توالي مربوط به قزلآلاي قهوهاي Salmo trutta رسم شد نتايج نشان داد كه بيشترين و كمترين مقدار فراواني نوكلئوتيدي به ترتيب مربوط به نوكلئوتيدهاي آدنين 26 13 و گوانين 80 52 بود تعداد 11 جايگاه ژني پليمورفيك 704 جايگاه ژني مونومورفيك 41 جهش و 12 هاپلوتايپ در نمونههاي مورد مطالعه شناسايي شد تنوع هاپلوتايپي و نوكلئوتيدي در سطح نمونهها به ترتيب برابر 448 6 و 13466 6 بود از 11 جايگاه ژني متغير شناسايي شده در تواليها 42 جايگاه هركدام تنها در يك فرد مشاهده شدند و 8 جايگاه حالت پارسيموني داشتند كه در بيش از يك نمونه تكرار شده بودند بيشترين تنوع هاپلوتايپي مربوط به دو جمعيت مازندران و چهارمحال و بختياري 666 2 و كمترين آن مربوط به جمعيتهاي آذربايجان غربي 415 6 و تهران 700 6 بود بيشترين تنوع نوكلئوتيدي در جمعيتهاي مازندران 37866 6 فارس 10066 6 و چهارمحال و بختياري 01566 6 و كمترين آن در جمعيتهاي آذربايجان غربي 05266 6 تهران 41366 6 و قزوين 25366 6 بود ترسيم شبكه هاپلوتايپي نشان داد كه تنها سه هاپلوتايپ گسترده با فواصل اندك در اغلب جمعيتها حضور دارد و ساير هاپلوتايپها هاپلوتايپهاي منفرد و غيرگسترده هستند بيشترين و كمترين ميانگين فواصل نوكلئوتيدي درون جمعيتي به ترتيب در جمعيت مازندران 8866 6 و آذربايجان غربي 0266 6 گزارش شد و در مجموع فواصل نوكلئوتيدي درون جمعيتي پايين بود فواصل نوكلئوتيدي بين جمعيتي نشان داد كه بيشترين فواصل نوكلئوتيدي در جمعيتهاي مازندران و فارس و كمترين آن در جمعيتهاي آذربايجان غربي و تهران وجود دارد بيشترين ميزان واگرايي بين جمعيت مازندران با جمعيت فارس 114 3 و چهارمحال و بختياري 546 3 و كمترين آن بين جمعيت آذربايجان غربي با تهران 151 6 و قزوين 541 2 به دست آمد نتايج آزمون AMOVA نشان داد كه 46 11 درصد از تنوع مربوط به تنوع درون جمعيتها بوده است تمايز ژنتيكي شاخص FST بين جمعيتهاي پرورشي موجود در اين مطالعه در سطح بسيار ناچيزي قرار داشت ترسيم درخت فيلوژنتيكي با استفاده از هاپلوتايپهاي شناسايي شده در اين مطالعه بيانگر نزديكي هاپلوتايپها در بين جمعيتهاي مختلف در گذشتهي نزديك يا استفاده از يك جمعيت مرجع در بين مراكز بود نتايج اين مطالعه ميتواند در راستاي مديريت ذخاير پرورشي مورد استفاده قرار گيرد واژگان كليدي تنوع هاپلوتايپي تنوع نوكلئوتيدي دياگرام فيلوژنتيكي شبكه هاپلوتايپي تمايز ژنتيكي

01 Genetic Diversity of Cultivated Stocks of Rainbow Trout Oncorhynchus mykiss Using Mitochondrial D loop Sequencing Amir Barati Boroujeni a barati@na iut ac ir September 12 2017 Department of Natural Resources Isfahan University of Technology Isfahan 84156 83111 Iran Degree MSc Language Persian Dr Salar Dorafshan sdorafshan@cc iut ac irAbstractThe genetic diversity of 56 samples of rainbow trout Oncorhynchus mykiss from 8 breeding centers located inTehran T Chaharmahal and Bakhtiari CB Kohgiluyeh and Boyerahmad KB Fars F West Azerbaijan WA Lorestan L Qazvin Q and Mazandaran M provinces in Iran was examined using control region D loop sequencing A part of 700 bp of D loop region was amplified using a pair of primers and 489 bp wassequenced successfully for 55 out of 56 samples Brown trout Salmo trutta D loop region was used as an outgroup for phylogenetic tree development The highest and lowest nucleotide diversities were related to Adenin 32 01 and Guanine 15 68 respectively From 489 bp sequenced 22 polymorphic and 467 monomorphicsites plus 24 mutations and 19 haplotaypes were determined Haplotype and nucleotide diversities were 0 844 and0 00432 respectively 14 out of 22 variable sites were only observed in one individual while 8 parsimony siteswere repeated more than once The highest haplotype diversities 1 00 were observed at samples belong to M andCB while the lowest ones 0 524 and 0 667 were observed at WA and T respectively M 0 00873 F 0 00662 and CB 0 00526 show the highest nucleotide diversities while the lowest nucleotide diversities were measuredat WA 0 00156 T 0 00324 and Q 0 00351 populations Haplotype network showed that three wide haplotypeswere presented in most populations while the rest haplotype were repeated only once In general the nucleotidediversity within populations was low however the highest and lowest average of nucleotide diversity wereobserved in the M 0 0088 and WA 0 0016 populations respectively The majority and minority of nucleotidediversities were between M and F and between WA and T respectively The highest divergence was observedbetween the population of M with F 3 429 and CB 0 345 and the lowest of that observed among the populationof WA with T 0 995 and Q 1 245 The results of AMOVA test showed that 99 04 of the variation was relatedto within populations Based on F ST value it could be concluded that genetic differentiation among populationwas very low Finally based on phylogenetic diagrams it could be stated that the separation from the commonancestor was happened recently The results of this study can be used in breeding programs for this economicalimportance species in Iran Keywords Haplotaype diversity nucleotide diversity phylogenetic diagram haplotaype network genetic differentiation

سالار درافشان

سجاد نظري

اميدوار فرهاديان، منصوره ملكيان