13240

1135 دكتري

دكتري

بيماري شناسي گياهي

اصفهان: دانشگاه صنعتي اصفهان، دانشكده كشاورزي

۱۳۹۶

يازده، [۸۲]ص.: مصور، جدول، نمودار

امير مساح، كرامت اله ايزدپناه

مجيد طالبي

جهانگير حيدرنژاد، جهانگير خواجه علي، رحيم مهرابي

1396/11/24

كتابنامه

كشاورزي

مهندسي كشاورزي

ID1135 دكتري

چكيده دراين پژوهش تنوع ژنتيكي جدايه هاي مختلف ويروس موزاييك ايراني ذرت جمع آوري شــده از مناطق جغرافيايي مختلف ايران و از ميزبان هاي مختلف ويروس با علايم متفاوت بر اسـاس توالي مربوط به ژن هاي نوكلئوكپسيد گليكوپروتيين و قطعه 005 جفت بازي از ژن پلي مراز و همچنين نواحي غير كد كننده بين ژن ها مورد مطالعه قرار گرفت تنوع ژنتيكي در ژن هاي نوكلئوكپسيد و گليكوپروتيين به ميزان 3 1 در صد و درژن پلي مراز 1 درصد بود تنوع ژنتيكي در نواحي غيركد كننده بيشتر از نواحي ژني بود به طوري كه در ناحيه بين ژن فسفوپروتيين و ژن 3 به بيش از 41 مي رسيد در تجزيه و تحليل هاي فيلوژنتيكي جدايه ها ارتباطي بين گروه بندي فيلوژنتيكي و منطقه جغرافيايي دامنه ميزباني و نوع علايم ويروســي ديده نشــد نســبت جانشــيني هاي نامترادف به مترادف كمتر از 1 وبيانگر وجود فشـار انتخاب منفي بر روي ژن هاي مورد مطالعه بود با توجه به اين كه ذرت گياه وارداتي به ايران است و كشت آن در سال هاي اخير توســعه يافته اســت به نظر مي رســد ويروس موزاييك ايراني ذرت از علف هاي هرز به ميزبان هاي زراعي و ذرت منتقل شــده اســت و احتمالا وابستگي شديد ويروس موزاييك ايراني ذرت به زنجرك ناقل به عنوان تنها راه انتقال شناخته شده براي ويروس مي تواند دليل پايين بودن تنوع ژنتيكي ويروس باشــد در اين مطالعه همچنين ميزان بيان تمامي ژن هاي ويروســي در چهار بازه زماني 7 41 12 و 82 روز پس از مايه زني ويروس توسط ناقل و همچنين در زنجرك ناقل انتقال دهنده ويروس Laodelphax striatellus توسط آزمون RT qPCR بررســي و اندازه گيري شــد ميزان ترانويســي ژن هاي G M gene 3 P و L نســبت به ژن N تعيين و با ژن هاي رفرنس 18S rRNA و 31 ribosomal protein S13 gene RPS به ترتيب در گياه و زنجرك نرمال ســازي صــورت گرفت در گياهان آلوده ميزان ترانويسـي ژن ها از سـمت ژن نوكلئوكپسيد به سمت ژن پلي مراز كاهش پيدا كرد به گونه اي كه بيشترين ميزان ترانويسي مربوط به ژن N و كمترين ميزان مربوط به ژن L بود در بازه هاي زماني مورد سـنجش بيشـترين ميزان ترانويسي مربوط به 41 روز پس از مايه زني و كمترين ميزان ترانويسي 12 روز پس از مايه زني بود در زنجرك ناقل ميزان ترانويسي ژن هاي G M و L كمتر از ساير ژن ها بود ميزان ترانويسـي ژن 3 در هر دو ميزبان گياه و زنجرك نسـبتا بالا بود نتايج تحقيق حاضـر نشان دهنده تشابه الگوي ترانويسي ـ در دو ميزبان گياه و زنجرك با رابدوويروس هاي جانوري مطالعه شــده بود و روند كاهشــي از ســمت 3 به 5 را نشــان داد اين نتايج وجود مكانيزم هاي تنظيمي ترانويسي ژن هاي ويروس مشابه رابدوويروس هاي جانوري را اثبات كرد به اين ترتيب ميزان ترانويسي ژن هاي ويروس در ارتباط مسـتقيم با ميزان تقاضـاي ويروس به محصول هر يك از ژن ها در طي فرآيند آلودگي مي باشد مطالعات مبتني بر تنوع ژنتيكي در ويروس هاي گياهي مي تواند اطلاعات با ارزشـي در خصـوص احتمال بروز نژادهاي جديد ويروس در اختيار ما قرار ـ ـ دهد تنوع ژنتيكي پايين در ويروس موزاييك ايراني ذرت مي تواند به عنوان يك عامل مهم در توليد واريته هايي با مقاومت پايدار در نظر گرفته شود كلمات كليدي ويروس موزاييك ايراني ذرت گروه بندي فيلوژنتيكي 18S rRNA RT qPCR Laodelphax striatellus و 31 ribosomal protein S13 gene RPS

Maize Iranian Mosaic Virus Genetic Diversity and Comparison of Virus Gene Transcription Levels in Maize and Planthopper Vector Mozhgan Hortamani Hortamani2005@yahoo com Department of Plant Protection College of Agriculture Isfahan University of Technology Isfahan 84156 83111 Iran1stSupervisor A Massah amassah@cc iut ac ir2ndSupervisor K Izadpanah izadpana@shirazu ac irAdvisor M Talebi mtalebi@cc iut ac ir Department of Plant Protection College of Agriculture Isfahan University of Technology Isfahan 84156 83111 Iran Department of Plant Protection College of Agriculture Shiraz University Shiraz 71441 65186 Iran Department of Agricultural Biotechnology College of Agriculture Isfahan University of Technology Isfahan84156 83111 IranAbstractMaize Iranian mosaic virus MIMV is a distinct member of the genus Nucleorhabdovirus In thisstudy the genetic diversity of MIMV isolates collected from different geographical regions ofIran different hosts and different symptoms was determined during 2015 2016 The sequences ofthe nucleocapsid protein glycoprotein and a 500 bp fragment of polymerase genes as well as non coding regions were determined Genetic diversity in coding regions was less than 1 3 innucleocapsid protein and glycoprotein genes and 1 in polymerase gene The diversity in non coding regions was higher compared to ORFs especially between P and gene 3 up to 14 7 Inphylogenetic analysis no correlation was found between MIMV isolates and geographical regions type of symptoms and hosts The ratio of non synonymous to synonymous polymorphic sitesindicated purifying selection has acted upon the analyzed gene Considering the fact that maizehas been imported to Iran and its cultivation has increased in recent years it appears that MIMVhas been transmitted from weeds or other field crops to maize by its planthopper vectors and likely the dependence of MIMV on planthoppers for spreading can explain its low diversity In this study also expression of all MIMV genes in maize during 28 days post inoculation dpi and ininoculative planthoppers Laodelphax striatellus was examined using quantitative RT PCR RT qPCR assay Accumulation of MIMV P gene 3 M G and L transcripts relative to the N transcriptswere determined and normalized to the 18S rRNA in maize plant and ribosomal protein S13 gene RPS13 in planthopper using the comparative CT method In plants higher levels of the MIMV Ntranscripts were found relative to other transcripts while MIMV L transcripts were at lowest levels The highest accumulation of MIMV transcripts was found at 14 dpi At 21 dpi we assessed thelowest transcript levels for all genes which increased again at 28 dpi although in lower amountsthan 14 dpi In Laodelphax striatellus MIMV M G and L transcripts accumulated at lower levelsthan other transcripts Gene 3 level was high in both plant and planthopper Our results showedthat transcript accumulation for the MIMV genes was similar in both hosts maize and planthopper and followed the pattern of sequential transcriptional attenuation from the 3 to the 5 end of thegenome similar to vertebrate infecting rhabdoviruses These results indicate the regulation of virus

امير مساح، كرامت اله ايزدپناه

مجيد طالبي

جهانگير حيدرنژاد، جهانگير خواجه علي، رحيم مهرابي