شماره راهنما :
1521 دكتري
پديد آورنده :
نجف پور، بابك
عنوان :
نمو لاروي آميخته بين قزل آلاي رنگين كمان (Oncorhynchus mykiss) و ماهي آزاد درياي خزر (Salmo caspius) با تأكيد بر توالي يابي RNA
گرايش تحصيلي :
تكثير و پرورش آبزيان
محل تحصيل :
اصفهان : دانشگاه صنعتي اصفهان
صفحه شمار :
پانزده، 99ص.: مصور (رنگي)، جدول، نمودار
استاد راهنما :
سالار درافشان
استاد مشاور :
فاطمه پيكان حيرتي، مانوئل مانچادو
توصيفگر ها :
نمو جنيني , آميخته تريپلوييد , بافت شناسي دستگاه گوارش , آنزيم هاي گوارشي , ترنسكريپتوم
استاد داور :
يزدان كيواني، مجيد طالبي، محمدعلي نعمت الهي
تاريخ ورود اطلاعات :
1398/09/27
رشته تحصيلي :
منابع طبيعي
دانشكده :
مهندسي منابع طبيعي
تاريخ ويرايش اطلاعات :
1398/09/27
چكيده فارسي :
1 چكيده در آبزيپروري از دگرآميزي براي توليد نسلهايي با صفات مطلوب استفاده ميشود در اين تحقيق ابتدا نمو جنيني ماهي آزاد درياي خزر در دماي ميانگين 1 9 درجه سانتيگراد و سپس توان بالقوه آميخته در آميخته تريپلوييد بين قزلآالي رنگينكمان ماده Oncorhynchus mykiss و ماهي آزاد درياي خزر نر Salmo caspius از منظر آنتوژني دستگاه گوارش مورد ارزيابي قرار گرفت و با گروههاي والديني مقايسه شد نمونههاي الرو بهمنظور بافت شناسي و سنجش آنزيمي آميالز ليپاز و تريپسين از آميخته هاي تريپلوييد و گونههاي والد در 3 تا 54 روز پس از تفريخ جمع آوري شدند جهت شناخت هر چه بيشتر زيست شناسي ماهيان آميخته و فرآيندهاي احتمالي درگير در مرگ و مير آنها از RNA seq به عنوان يكي روشهاي نو ظهور Next generation sequencing براي ارزيابي ترنسكريپتوم ماهيان آميخته ديپلوييد و تريپلوييد و گونههاي والد قزلآالي رنگينكمان ماده و ماهي آزاد درياي خزر نر در 12 روز پس از تفريخ بهره گرفته شد سپس عمكرد زيستي هر يك از گروهها با تاكيد بر بيان ژنهاي منحصر به هر گروه مورد ارزيابي قرار گرفت تحليل ريختشناسي مراحل بحراني نمو جنيني را مشخص كرد بهطوريكه اولين شكاف تقسيم در 981 درجه ساعت بالستودرم چند سلولي در روز 26 درجه روز حلقه زاينده در 27 درجه روز كيل عصبي در 88 درجه روز بسته شدن بالستوپور در 731درجه روز چشمزدگي در 881درجه روز و تفريخ الروها در 373 درجه روز پس از لقاح رخ دادند نتايج حاصل از مطالعه آنتوژني دستگاه گوارش نشان داد كه نمو دستگاه گوارش و آنزيم هاي گوارشي آميخته تريپلوييد بيشتر شبيه به قزلآالي رنگينكمان است دستگاه گوارش به خوبي نمو يافته با افزايش سن شكل گرفت و زوائد پيلوريك و نيز معده U شكل در قزلآالي رنگينكمان آميخته تريپلوييد و ماهي آزاد درياي خزر به ترتيب در 62 53 و 04 روز پس از تفريخ قابل مشاهده بود افزايش ناگهاني فعاليت تريپسين در 13 53 و 54 روز پس از تفريخ در ماهي آزاد درياي خزر قزلآالي رنگينكمان و آميخته تريپلوييد مشخص شد به طوركلي ماهيان آميخته بهتر رشد كرده و رشد سريعتري در دستگاه گوارش نسبت به ماهي آزاد درياي خزر داشتند اما قزلآالي رنگينكمان بهترين عملكرد را داشت آناليز ترنسكريپتوم ماهيان آميخته ديپلوييد و تريپلوييد بين قزلآالي رنگينكمان ماده و ماهي آزاد درياي خزر نر و گونههاي والد نشان دهنده تفاوت در زيستشناسي ماهيان توليدي و نيز تاثير تريپلوييدي بر عمكرد زيستي ماهيان آميخته بود تحليـــل غنـــيســـازي خـــانواده ژنـــي غنيشدن Go ترمهاي مانند ماهيچه اندام و شكلگيري استخوان و برخي ترمهاي ايمني را نشان داد آناليز اوليه ترنسكريپتوم ماهيان توليدي نشان دهنده وجود تفاوت در عمكرد و مكان عمل ژنهاي بيان شده مختص به هر گروه بود GO ترمهاي مربوط به رشد و نمو استخوان ماهيچه و اندمهاي مانند قلب در ماهيان آميخته ديپلوييد و تريپلوييد غني شده بودند بيشترين تعداد GO ترمهاي غنيشده مربوط به آميخته تريپلوييد بين قزلآالي رنگينكمان و ماهي آزاد درياي خزر و كمترين GO ترمها مربوط به قزلآالي رنگينكمان بود در ماهي قزلآالي رنگين كمان تنها GO ترم تقسيم هسته ميوزي جنس نر غني شده بود در ماهي آزاد درياي خزر GO ترم مژه يا تاژك وابسته به تحرك سلول داري بيشترين امتياز غنيسازي بود به طوركلي نتايج بدست آمده در اين تحقيق هم جهت كاربرد در بخش آبزيپروري و هم بهعنوان مبنايي براي مطالعات آينده قابل استفاده است واژگان كليدي نمو جنيني آميخته تريپلوييد بافتشناسي دستگاه گوارش آنزيمهاي گوارشي ترنسكريپتوم
چكيده انگليسي :
100 Larval development of the hybrid between rainbow trout Oncorhynchus mykiss and Caspian brown trout Salmo caspius with emphasis on RNA sequencing Babak Najafpour b najafpour@na iut ac ir Department of Natural Resources Isfahan University of Technology Isfahan 84156 83111 IranDegree PhD Language PersianDr Salar Dorafshan sdorafshan@iut ac irAbstractIn aquaculture hybridization is used to produce animals with favorable traits In present study first theembryonic development of Caspian brown trout at 9 1 C and then the potential hybrid vigor in triploidhybrids between female rainbow trout RT Oncorhynchus mykiss and male Caspian brown trout CT Salmo caspius of aspect of the the gastrointestinal tract GI tract ontogeny was assayed and comparedto the parental species Larvae samples were collected for histology and enzymatic assays amylase lipase and trypsin from the triploid hybrids and its parents at 3 to 45 days post hatch dph To knowmore about hybrid fish biology and possible mechanisms involved in their mortality RNA seq as one ofthe emerging Next generation sequencing methods was used to evaluate transcriptome of the diploid andtriploid hybrid fish and the parental species RT and CT at 21 days post hatch Then the biologicalfunction of each group was evaluated with emphasis on the expression of genes unique to each group Morphological analysis of landmark stages of embryonic development revealed that first cleavageoccurred at 189 degree h a many celled blastoderm formed at 62 degree days dd a germ ring at 72 dd the neural keel stage at 88 dd the blastopore closed at 137 dd the eye became pigmented at 188 dd andthe larvae hatched at 373 dd The results showed that the development of the GI tract and digestiveenzymes of the triploid hybrid was more like the RT The well developed GI tract was formed with ageand the pyloric caeca and also the U shaped stomach were clearly visible at 26 35 and 40 dph in the RT triploid hybrid and CT respectively An abrupt increase in trypsin activity at 31 35 and 45 dph wasidentified in the CT RT and the triploid hybrid respectively The triploid hybrid grew better and had afaster GL tract development than the CT but the RT performed best overall Analysis of transcriptomeof the diploid and the triploid hybrid fish between female RT and male CT and the parental speciesshowed differences in the biology of fish produced and the effect of triploidy on the hybrid fish biology The Gene set enrichment analysis revealed the enrichment of the GO terms such as muscle organ bonemorphogenesis and some immune genes terms Initial analysis of the transcriptome of the produced fishshowed difference in the function and location of the genes expressed in each group GO terms relatedto the bone and the muscle development and organs such as heart were enriched in the diploid and thetriploid hybrids The highest number of the enriched GO terms belonged to the triploid fish between theRT and CT and the least GOs belonged to the RT In the RT just male meiotic nuclear division GO termwas enriched In the CT Cilium or flagellum dependent cell motility GO term had the highest enrichmentscore In general the results obtained in this study can be used as a basis for future studies in theaquaculture sector Keywords Embryonic development Triploid hybrid Gasterointestinal histology Digestive enzymes Transcriptome
استاد راهنما :
سالار درافشان
استاد مشاور :
فاطمه پيكان حيرتي، مانوئل مانچادو
استاد داور :
يزدان كيواني، مجيد طالبي، محمدعلي نعمت الهي