پديد آورنده :
شمس ناتري، سهيل
عنوان :
استفاده از باركدهاي گياهي براي شناسايي گونه آزولا تالاب انزلي
مقطع تحصيلي :
كارشناسي ارشد
گرايش تحصيلي :
بيوتكنولوژي كشاورزي
محل تحصيل :
اصفهان : دانشگاه صنعتي اصفهان
صفحه شمار :
پانزده، 90ص. : مصور، جدول، نمودار
استاد راهنما :
مجيد طالبي، بدرالدين ابراهيم سيدطباطبايي
توصيفگر ها :
آزولا , تنوع ژنتيكي , باركدهاي DNA , SRAP , SCoT , A.caroliniana
استاد داور :
بنفشه خليلي، رحيم مهرابي
تاريخ ورود اطلاعات :
1399/06/25
تاريخ ويرايش اطلاعات :
1399/06/26
چكيده فارسي :
چكيده آزوال گياهي شناور از جنس سرخس آبزي با برگهاي كوچك از خانواده Azollaceae ميباشد طبقه بندي گونههاي مختلف آزوال بسيار بحث برانگيز است و به همين دليل تعيين گونههاي آزوالي موجود در ايران را نيز دشوار كرده است علي رغم مطالعات انجام شده در زمينه تنوع ژنتيكي آزوال هنوز رابطه مشخصي بين آزوالهاي موجود در ايران و نسبت آن ها با ساير گونههاي آزوال مشاهده نشده است گونه آزوالي موجود در ايران در بخش مركزي انزلي ماسال و ساري نامشخص است و مطالعات مختلف اين نمونهها را از گونه A filiculoides يا A pinnata دانستهاند باركدهاي DNA ابزاري مولكولي براي شناسايي سريع قابل اعتماد و بسيار موثر گونهها مطرح شده است كه در اين روش از يك توالي خاص DNA در هر گونه استفاده ميشود در اين مطالعه از توالييابي نواحي هستهاي و كلروپالستي ITS trnG trnR trnL trnF و از نشانگرهاي SRAP و SCoT جهت مشخص كردن رابطه ژنتيكي بين ژنوتيپهاي آزوال استفاده شد دندوگرامهاي رسم شده بر اساس تواليهاي موجود در بانك ژن و قطعات توالي يابي شده نواحي كلروپالستي و هستهاي ITS trnG trnR trnL trnF نشان داد كه سه نمونه جمع آوري شده از تاالب انزلي مزارع برنج ماسال و كانال دانشگاه كشاورزي و منابع طبيعي ساري با ميانگين اطمينان 38 درصد با گونه A caroliniana در يك خوشه و با فاصله ژنتيكي صفر قرار ميگيرند ازطرفي فاصله ژنتيكي نمونههاي ايران با گونه Azolla sp نيز صفر است اما به دليل ناشناخته بودن اين گونه به عنوان معيار تشخيص در اين مطالعه قرار نگرفت همچنين نمونههاي آزوالي ايران با گونه A nilotica و A pinnata بيشترين فاصله ژنتيكي را داشتند نتايج حاصل از دادههاي نشانگر SCoT و SRAP نيز نشان داد كه نمونههاي آزوالي موجود در ايران تشابه ژنتيكي بااليي دارند و احتماال از يك گونه ميباشند و فاصله ژنتيكي زيادي با گونه A pinnata دارند به اين ترتيب با توجه به نتيجه تحقيق حاضر و نتايج تحقيقات قبلي بر روي نمونههاي ايراني مي توان گفت آزوالي موجود در ايران از نوع A filiculoides و A pinnata نيست و نزديك به گونه A caroliniana ميباشد كلمات كليدي آزوال تنوع ژنتيكي باركدهاي A caroliniana SCoT SRAP DNA ط
چكيده انگليسي :
Use of plant barcodes to identify Azolla species in Anzali wetland Soheil Shams Nateri Soheil shams@ag iut ac ir Jan 25 2020 Department of Agricultural Biotechnology Isfahan University of Technology Isfahan 84156 83111 Iran Degree M Sc Language Persian 1 M Talebi Associate Professor Supervisor mtalebi@cc iut ac ir 2 B E Sayed Tabatabaei Professor Supervisor sayedt@cc iut ac irAbstractAzolla is a floating fern with small leaves of the Azollaceae family The classification of differentAzolla species is highly controversial making it difficult to identify Azolla species in Iran Despitestudies on the genetic diversity of Azolla there is still no clear relationship between Azolla in Iranand its relation to other Azolla species Azolla species present in Iran in central part of Anzali Masaland Sari are unknown and various studies have identified it as A filiculoides or A pinnata DNAbarcoding is a molecular tool for rapid reliable and highly effective species identification that usesa specific DNA sequence in each species In this study sequencing of nuclear and chloroplasticregions ITS trnG trnR trnL trnF and SRAP and SCoT markers used to determine the geneticrelationship between Azolla genotypes Dendrograms based on barcode sequences in the gene bankand sequences of chloroplast and nuclear regions ITS trnG trnR trnL trnF showed that threesamples collected from Anzali wetland Masal rice fields and Sari University of Agriculture andNatural Resources channel placed in a cluster with average similarity of 83 with A caroliniana andzero genetic distance The genetic distance of novel Azolla sp with Iranian samples was zero but it isnot included in this study as a diagnostic criterion because it was an unknown species Also Azollasamples of Iran with A nilotica and A pinnata had the highest genetic distance The results of SCoTand SRAP markers data also showed that Azolla samples in Iran have high genetic similarity and areprobably of the same species and have high genetic distance with A pinnata Therefore according tothe results of the present study and the results of previous researches it can be concluded that theAzolla in Iran is not A filiculoides and A pinnata and is close to A caroliniana Keywords Azolla genetic diversity DNA barcoding SRAP SCoT A caroliniana 91
استاد راهنما :
مجيد طالبي، بدرالدين ابراهيم سيدطباطبايي
استاد داور :
بنفشه خليلي، رحيم مهرابي
