پديد آورنده :
مرآتيان، سپهر
عنوان :
شناسايي و تجزيه و تحليل ميكرو ار.ان.آها در گونه‌هاي مختلف آويشن (Thymus)
مقطع تحصيلي :
كارشناسي ارشد
گرايش تحصيلي :
بيوتكنولوژي
محل تحصيل :
اصفهان : دانشگاه صنعتي اصفهان
صفحه شمار :
هشت 54ص:مصور،شكل، جدول
استاد راهنما :
ابوذر سورني
توصيفگر ها :
آويشن , NGS , miRNAs , ترپن‌ها , متابوليت‌هاي ثانويه , بيوانفرماتيك , مسيرهاي تنظيمي
استاد داور :
مجيد طالبي، امير مساح
تاريخ ورود اطلاعات :
1401/02/27
تاريخ ويرايش اطلاعات :
1401/02/28
چكيده فارسي :
چكيده
امروزه گياهان دارويي به دليل متابوليت‌هاي مؤثر آن‌ها در درمان بسياري از بيماري موردتوجه همگان قرارگرفته‌اند. يكي از اين گياهان آويشن نام دارد كه حاوي گستره وسيعي از متابوليت‌هاي ثانويه مي‌باشد. از جمله اين مواد به ترپن‌ها و فلاونوييدها و آنتي‌اكسيدان‌ها مي‌توان اشاره كرد. تكنيك‌ها و روش‌هاي مختلفي براي افزايش و توليد اين مواد ابداع شده است. در روش‌هاي كلاسيك عوامل محيطي دستخوش تغييرات قرار داده مي‌شود تا بيشترين ماده مؤثر در گياهان دارويي توليد شود اما در رويكرد‌هاي جديد‌تر كه مبتني بر ژنتيك گياه هستند بازده بالاتر مشاهده مي‌شود. از جمله اين رويكرد‌ها استفاده از miRNAs مي‌باشد. miRNAs يك رده از RNAs تنظيم‌كننده كوچك درون‌هسته‌اي و غيركدكننده پروتئيني هستند كه متشكل از حدود 17-24 نوكلئوتيد مي‌باشند. miRNAs بيان ژن را پس از رونويسي از طريق تجزيه mRNA يا مهار ترجمه آن‌ها كنترل كرده و نقش‌هاي متنوعي را در فرايندهاي بيولوژيكي و متابوليكي در گياهان و جانوران بازي مي‌كنند. روش‌هاي متعددي براي شناسايي miRNAs موجود مي‌باشد كه يكي از ساده‌ترين و كم‌هزينه‌ترين آن‌ها، روش شناسايي بيوانفورماتيكي مي‌باشد. در اين مطالعه با هدف شناسايي miRNA متمايز در گياه آويشن، مطالعه‌اي مبتني بر جستجوي همولوژي بين اطلاعات ترانسكريپتومي گياه آويشن و miRNA انجام گرفت. بطوريكه ابتدا اطلاعات ترانسكرپتومي گياه آويشن پالايش شدند و سپس با انجام بلاست در برابر تمام miRNAs شناخته‌شده موجود در بانك اطلاعاتي miRBase انجام شد و در نهايت 64 miRNA كانديد متمايز در گونه‌هاي مختلف گياه آويشن شناسايي شد. ژن‌هاي هدف شناسايي‌شده با استفاده از نرم‌افزارهاي مختلف موردبررسي قرار گرفتند. از اين تعداد 14 عدد در مسيرهاي سنتزي ترپن‌ها مشاهده شدند.
چكيده انگليسي :
Abstract
Today, medicinal plants have attracted the attention of many individuals because of their secondary metabolites in the treatment of many diseases. One of these plants is called thyme, which contains a wide range of secondary metabolites. These include terpenes, flavonoids and antioxidants. Various techniques and methods have been developed to increase and produce these materials. In classical methods, environmental factors are changed to produce the most effective substance in medicinal plants, but in newer approaches that are based on plant genetics, higher yields are observed. One of these approaches is the use of miRNAs. miRNAs are a class of small RNAs that encode and encode non-coding proteins consisting of about 17-24 nucleotides. miRNAs. They control gene expression after transcription by mRNA analysis or inhibition of their translation, and play a variety of roles in biological and metabolic processes in plants and animals. There are several methods for identifying miRNAs, one of the simplest and least expensive of which is the bioinformatics detection method. In this study, in order to identify distinct miRNA in thyme, a study based on homology search between transcript information of thyme and miRNA was performed. First, transcriptomic information of thyme was refined and then blast was performed against all known miRNAs in the miRBase database, and finally 64 distinct candidate miRNAs were identified in different species of thyme. The identified target genes were analyzed using different software. In conclusion 14 miRNAs were observed in the synthetic pathways of terpenes.
استاد راهنما :
ابوذر سورني
استاد داور :
مجيد طالبي، امير مساح
