شماره مدرك :
18894
شماره راهنما :
16389
پديد آورنده :
انصاري پور، سعيده
عنوان :

ارزيابي مولكولي و فنوتيپي ارقام مختلف فلفل دلمه اي براي مقاومت به ويروس پژمردگي لكه اي گوجه فرنگي

مقطع تحصيلي :
كارشناسي ارشد
گرايش تحصيلي :
ويروس شناسي
محل تحصيل :
اصفهان : دانشگاه صنعتي اصفهان
سال دفاع :
1402
صفحه شمار :
يازده،64ص.:مصور،جدول،نمودار
توصيفگر ها :
فلفل دلمه اي , ويروس پژمردگي لكه اي گوجه فرنگي , ژنوتيپ , مقاومت , ژن Tsw
تاريخ ورود اطلاعات :
1402/07/24
كتابنامه :
كتابنامه
رشته تحصيلي :
بيماري شناسي گياهي
دانشكده :
مهندسي كشاورزي
تاريخ ويرايش اطلاعات :
1402/07/26
كد ايرانداك :
2973522
چكيده فارسي :
فلفل دلمه اي (Capsicum annum L.) گياهي با ارزش اقتصادي و تغذيه اي بالا، متعلق به خانواده Solanaceae مي باشد. ويروس پژمردگي لكه اي گوجه فرنگي tomato spotted wilt virus (TSWV) به عنوان يكي از مخرب ترين ويروس هاي فلفل دلمه اي هر ساله باعث ايجاد خسارت هاي كمي و كيفي روي اين محصول مي گردد. اين ويروس در طبيعت توسط گونه هاي مختلف تريپس به ويژه Frankliniella occidentalis منتقل مي شود. كنترل TSWV به دليل وسيع بودن دامنه ميزباني ويروس و ناقل آن مشكل مي باشد. كنترل شيميايي ناقلين به دليل مقاومت ناقل به حشره كش ها كارايي پاييني دارد. امروزه استفاده از ارقام مقاوم فلفل دلمه اي داراي تك ژن غالب Tsw يكي از موثرترين روش هاي كنترل اين بيماري محسوب مي شود. هدف اصلي اين پژوهش، غربالگري ارقام فلفل دلمه اي براي رديابي ژن مقاوم Tsw با استفاده از نشانگر SCAC568 و ارزيابي فنوتيپي آن ها با استفاده از روش مايه زني مكانيكي در شرايط گلخانه بود. به منظور رديابي ژن مقاوم Tsw ، 40 ژنوتيپ فلفل دلمه اي جمع آوري گرديد و استخراج DNA به روش CTAB انجام شد. آزمون PCR با استفاده از جفت اغازگر SCAC568F/SCAC565R انجام و محصول PCR توسط آنزيم برشي XbaI برش داده شد. بر اساس نتايج به دست آمده از تجزيه و تحليل مولكولي، ژن Tsw پيوسته به نشانگر SCAC568 در ژنوتيپ هاي Bachata، Darsena، SV99082 و Simpity به به صورت تك باند و هموزيگوس و در ژنوتيپ هاي Aranica، H127-1، H300، H414، H253، H124-1، Tormes و Lorca به صورت دو باند و هتروزيگوس رديابي گرديد. به منظور تهيه منبع TSWV، جمع آوري نمونه هاي آلوده به ويروس از گلخانه هاي فلفل دلمه اي در استان اصفهان انجام شد. از برگ ها و ميوه هاي فلفل دلمه اي داراي علائم لكه هاي حلقوي سبز زرد و بافت مرده ،استخراج RNA كل انجام و آزمون RT-PCR با استفاده از جفت آغازگر هاي FJJ200274/FJJ200275 و Tobamo-F/Tobamo-R به ترتيب جهت تاييد آلودگي نمونه ها به TSWV و عدم آلودگي آن ها به توباموويروس ها ي آلوده كننده فلفل دلمه اي انجام شد. در نمونه ها قطعه مورد انتظار bp810 با جفت آغازگر اختصاصي FJJ200274/FJJ200275 تكثير شد، اما هيچ قطعه اي با جفت آغازگر Tobamo-F/Tobamo-R تكثير نگرديد. جهت خالص سازي بيولوژيكي ويروس، از بافت برگ يا ميوه گياهان بررسي شده در RT-PCR عصاره گيري شد و مايه زني مكانيكي روي برگ هاي گياه توتونNicotinia glutinosa در مرحله چهار تا پنج برگي انجام شد. پس از 10-7 روز علايم لكه هاي حلقوي موضعي و سپس علايم موزاييكي روي برگ هاي ايجاد شدند. جهت ارزيابي فنوتيپي بيماري، 35 رقم فلفل دلمه اي در مرحله چهار تا پنج برگي با استفاده از بافت برگ N. glutinosa مايه زني شدند و در زمان هاي 14، 21 و 28 روز پس از مايه زني بر اساس شدت علايم، امتياز دهي انجام گرديد. بر اساس ارزيابي فنوتيپي 28 روز پس از مايه زني تنها پنج ژنوتيپ Sanston، Cassiano، Paramo و Lemonchelo و Tarento كه در ارزيابي ژنتيكي توسط نشانگر SCAC568F/SCAC565R فاقد ژن مقاوم بودند، به عنوان مقاوم و بقيه ارقام به عنوان حساس ارزيابي شدند. در هيچكدام از اين ارقام ژن Tsw رديابي نشد. در تمامي ژنوتيپ ها مورد استفاده در ارزيابي فنوتيپي، در آزمون RT-PCR با استفاده از جفت آغازگر اختصاصي FJJ200274/FJJ200275 قطعه مورد انتظار bp810 تكثير شد، به همين دليل به نظر مي رسد ژنوتيپ ها ي فوق نسبت به TSWV متحمل باشند. حساس بودن ژنوتيپ ها ي H300، H253،H414،H124-1، H127-1، Tormes،Lorca،Darsena،Bachata، Aranica، SV99082 و Simpiy نسبت به TSWV با وجود دارا بودن ژن مقاوم Tsw مي تواند به دليل شكست مقاومت باشد. همچنين عدم وجود ژن مقاوم Tsw در ژنوتيپ ها ي مقاوم نشان دهنده وجود منابع جديدي از مقاومت در آن ها است. شناسايي ژن يا ژن هاي دخيل در اين ژنوتيپ ها مي تواند باعث افزايش بينش ما در زمينه مكانيسم هاي مقاومت به بيماري ناشي از TSWV در فلفل دلمه اي شود. كلمات كليدي: فلفل دلمه اي، ويروس پژمردگي لكه اي گوجه فرنگي، ژنوتيپ، مقاومت، ژن Tsw
چكيده انگليسي :
Bell pepper (Capsicum annum L.) is a vegetable crop with high economic and nutritional value, belonging to the Solanaceae family. Tomato spotted wilt virus (TSWV) as one of the devastating viruses infecting bell pepper annually causes both quantitative and qualitative losses. The virus is transmitted in nature by different species of thrips, especially Frankliniella occidentalis. TSWV control is challenging due to the wide host range of the virus and its vector and the rapid acquisition of resistance to insecticides. One of the most effective tools for controling the disease in bell pepper is to use resistant cultivars harboring the Tsw resistance gene. In this study, bell pepper genotype screening for the Tsw gene using the SCAC568 marker and phenotypic analysis using mechanical inoculation method under greenhouse conditions were performed. To detect the Tsw gene, total DNA from 40 bell pepper genotypes was extracted and subjected to PCR method using the SCAC568F/SCAC565R primer pair. The PCR products were subsequently digested using XbaI restriction enzyme. In molecular analysis, the Tsw gene, tightly linked to the SCAC568 marker, was detected in Bachata, Darsena, SV99082 and Simpity genotypes as homozygous and in Aranica, H127-1, H300, H414, H253, H124-1, Tormes and Lorca genotypes as heterozygous. To prepare a source of TSWV, samples showing chlorotic and necrotic ring spots were collected from greenhouse bell pepper in Isfahan province. Total RNA was extracted from the leaves or fruits of bell pepper and RT-PCR was performed using FJJ200274/FJJ200275 and Tobamo-F/Tobamo-R primer pairs. The expected 810 bp fragment was amplified using FJJ200274/FJJ200275 primer pair, while no fragment was amplified with the Tobamo-F/Tobamo-R primer pair. To biologically purify the virus, extracted leaf or fruit tissue which had been tested by RT-PCR, mechanically inoculated on the leaves of Nicotiana glutinosa at the 4-5 leaf stage. After 7-10 days, symptoms of local ring spots and mosaic symptoms appeared on the leaves. For phenotypic analysis, 35 bell pepper genotypes were mechanically inoculated with TSWV at the 4-5 leaf stage and scored at 14, 21 and 28 days post inoculation (dpi), based on the symptom severity. In phenotypic analysis, Sanston, Cassiano, Paramo, Lemonchelo and Tarento genotypes were eva‎luated as resistant at 28 dpi. The Tsw gene was not detected in any of these genotypes. In all genotypes the expected 810 bp fragment was amplified using FJJ200274/FJJ200275 primer pair in RT-PCR. These finding suggest that these genotypes are tolerant to TSWV. The susceptibility of H300, H253, H414, Tormes, Lorca, Darsena, Bachata, Aranica, Simpiy, SV99082, H124-1 and H124-1 genotypes, despite having the Tsw gene indicates a breakdown of resistance to the TSWV Iranian isolate. Additionally, the absence of the Tsw gene in some resistant genotypes highlights the presence of new sources of resistance. The identification of the involved gene(s) in these genotypes expands our knowledge of the resistance mechanisms to TSWV disease in bell pepper. Keywords: Bell pepper, Tomato spotted wilt virus, Genotype, Resistance, Tsw gene
استاد راهنما :
امير مساح
استاد مشاور :
بهرام شريف نبي
استاد داور :
جهانگير خواجه علي , ابوذر سورني
لينک به اين مدرک :

بازگشت