توصيفگر ها :
خارمريم , تنوع ژنتيكي , نشانگر SRAP , نشانگر SCoT
چكيده فارسي :
خارمريم (Silybum marianum) گياهي علفي، خاردار، بدون كرك، يكساله يا دوساله از خانواده كاسني مي‌باشد. سيليمارين كه تركيبي از انواع فلاونوليگنان‌ها است، به‌عنوان ماده مؤثره اين گياه شناخته مي‌شود. اين گياه يكي از گياهان دارويي با خصوصيت دارويي منحصر به فرد در درمان بيمارهاي كبدي است و در گذشته براي درمان بيماري‌هاي مرتبط با صفرا و همچنين مسموميت حاد ناشي از مصرف قارچ‌هاي سمي مورد استفاده قرار مي‌گرفت. علاوه بر اين، در درمان بيماري‌هاي مختلفي از جمله بيماري‌هاي هپاتيت، ديابت، بيماري‌هاي قلب و عروق، سرطان و چربي خون بسيار مؤثر مي‌باشد. در طب سنتي نيز در درمان انواع بيماري‌ها از ريشه و اندام هوايي خارمريم كه داراي طعمي تلخ و اثر اشتهاآور است، بهره مي‌برند. با وجود اهميت اقتصادي و دارويي اين گياه، مطالعات مولكولي محدودي به منظور بررسي تنوع ژنتيكي خارمريم صورت گرفته است. در اين پژوهش براي بررسي تنوع ژنتيكي خارمريم از نشانگرهاي مولكولي SCoT و SRAP كه نواحي بيان شونده ژنوم را مورد هدف قرار مي‌دهند، استفاده گرديد. يازده تركيب آغازگري SRAP و سيزده آغازگر SCoT بر روي 30 اكوتيپ خارمريم به ترتيب 103 و 165 نوار تكثير نمودند كه از اين تعداد، به ترتيب % 04/61 و % 88/73 چندشكلي نشان دادند. ميانگين محتواي اطلاعات چندشكل براي تركيب آغازگر SRAP، 407/0 و براي آغازگر SCoT، 426/0 محاسبه شد. تجزيه خوشه‌اي با استفاده از ضريب تشابه راسل و رائو و الگوريتم UPGMA با ضريب همبستگي كوفنتيك 91/0 براي نشانگر SRAP و 87/0 براي نشانگر SCoT و 90/0 براي تركيب SCoT و SRAP انجام شد كه تا حدودي بيانگر تفكيك جمعيت‌هاي مختلف بود. نتايج حاصل از نشانگر SRAP (138/0(Fst= و نشانگر ) SCoT 103/0(Fst= و تركيب SCoT و SRAP (115/0(Fst= بيان كننده تنوع ژنتيكي و جريان ژني نسبتاً بالا در بين جمعيت‌هاست. به اين ترتيب كه Nm در مورد نشانگر SRAP، 56/1 و در مورد نشانگر SCoT، 18/2 و تركيب SCoT و SRAP، 02/2 محاسبه گرديد. مشاهده درصد تنوع جمعيت‌ها نشان دهنده وجود منبع ژرم‌پلاسم غني جهت استفاده در برنامه‌هاي اصلاحي است. از طرفي نتايج حاصل از بررسي ساختار جمعيت‌ها با استفاده از نرم‌افزار Structure حاكي از تبادل ژنتيكي فراوان و اختلاط جمعيت‌ها مي‌باشد. به طور كلي نتايج نشان مي‌دهند كه طبقه بندي اكوتيپ‌هاي خارمريم مستقل از منشأ جغرافيايي آن‌ها است.
چكيده انگليسي :
Milk Thistle (Silybum Marianum) is an herbaceous, prickly, glabrous, annual or biennial plant from the family of Asteraceae. Silymarin, which is a combination of flavonolignans, is known as the effective ingredient of this plant. This plant is one of the medicinal plants with unique medicinal properties in the treatment of liver diseases. Also, in the past, it was used to treat the diseases related to bile as well as acute poisoning caused by the consumption of poisonous mushrooms. In addition, the plant is very useful for the treatment of various diseases such as hepatitis, diabetes, cardiovascular diseases, cancer, and blood fat. Moreover, the root and aerial parts of the thistle, which have a bitter taste and an appetizing effect, are employed to treat various diseases in traditional medicine. Despite the economic and medicinal importance of this plant, limited molecular studies have been conducted to investigate the genetic diversity of Milk Thistle. In this study, SCoT and SRAP molecular markers that target the expressed regions of the genome were used to investigate the genetic diversity of Milk Thistle. Eleven SRAP primer combinations and thirteen SCoT primers amplified 103 and 165 bands, respectively, on 30 Milk Thistle genotypes, of which 61.04% and 73.88% showed polymorphism, respectively. The average of polymorphic information content was obtained 0.407 for SRAP primer combination and 0.426 for SCoT primer. A cluster analysis was carried out using Russell and Rao's similarity coefficient and UPGMA algorithm with cophentic correlation coefficient of 0.91 for SRAP indicator, 0.87 for SCoT indicator, and 0.90 for the combination of SCoT and SRAP, which to some extent showed the separation of different populations. The results of SRAP marker (Fst=0.138), SCoT marker (Fst=0.103), and the combination of SCoT and SRAP (Fst=0.115) suggested a relatively high genetic diversity and gene flow among the populations. In a way that Nm was found 1.56 for the SRAP indicator, 2.18 for the SCoT indicator, and 2.02 for the combination of SCoT and SRAP. Observing the population diversity percentage indicates the presence of a rich germplasm source for use in breeding programs. Besides, the results of examining the structure of populations using Structure software show a lot of genetic exchange and mixing of populations. In general, the results reveal that the classification of Milk Thistle ecotypes is independent of their geographical origin.
