پديد آورنده :
بصيري، راضيه
عنوان :
بررسي تئوري برهم‌كنش متوتروكسات با بتاسيكلودكسترين و مونوكلروتري‌آزينيل بتاسيكلودكسترين
مقطع تحصيلي :
كارشناسي ارشد
محل تحصيل :
اصفهان : دانشگاه صنعتي اصفهان
صفحه شمار :
پانزده، 72ص. : مصور، جدول، نمودار
توصيفگر ها :
بتاسيكلودكسترين , مونوكلروتري‌آزينيل بتاسيكلودكسترين , داروي متوتروكسات , دارورساني هدفمند , داكينگ مولكولي , شبيه‌سازي ديناميك مولكولي
تاريخ ورود اطلاعات :
1403/10/16
تاريخ ويرايش اطلاعات :
1403/10/17
چكيده فارسي :
در اين پژوهش، از طريق محاسبات، برهم‌كنش داروي متوتروكسات با بستر بتاسيكلودكسترين و همچنين ايزومرهاي مختلف مولكول مونوكلروتري‌آزينيل بتاسيكلودكسترين با استفاده از داكينگ مولكولي و شبيه‌سازي ديناميك مولكولي براساس انرژي آن‌ها بررسي شد، همچنين اتصال مولكولي براي كمپلكس‌ها براي كشف مناسب‌ترين جهت‌گيري و پيكربندي از طريق تصاوير لحظه‌اي انجام شد و در نمودار RDF يا g(r) مشاهده شد كه شدت پيك‌ها براي حالت كمپلكس كمي كمتر از حالت آزاد است كه به دليل خارج‌شدن مولكول‌هاي آب از درون حفره و جايگزيني داروي متوتروكسات در حفره‌ي mct با نسبت 1:1 مي‌باشد، همچنين در نمودار SASA مشاهده شد كه كمپلكس‌شدن متوتروكسات با مونوكلروتري‌آزينيل بتاسيكلودكسترين به دليل داشتن 3 استخلاف مونوكلروتري‌آزينيلي، سطح قابل دسترس براي مولكول‌هاي حلال را افزايش مي‌دهد، همچنين مي‌توان از نمودارهايRMSD و پيوندهاي هيدروژني نتيجه گرفت كه وجود متوتروكسات باعث پايدارشدن كمپلكس‌ها مي‌شود و نيز كمپلكس‌ها انرژي برهم‌كنش واندروالسي منفي‌تري نسبت به انرژي برهم‌كنش الكتروستاتيكي دارند كه از ميان ايزومرهاي مختلف mct، ايزومر چهارم با انرژي برهم‌كنش واندروالسي و انرژي برهم‌كنش الكتروستاتيكي (به ترتيبkJ mol-1 65/185- وkJ mol-1 03/55-) ميل اتصال بهتر و پيوندهاي هيدروژني قويتري با mtx دارد.
چكيده انگليسي :
In this research, through theoretical calculations, the interaction of methotrexate drug with beta-cyclodextrin substrate as well as different isomers of monochlorotriazinyl beta-cyclodextrin molecule was investigated using molecular docking and molecular dynamics simulation based on their energy. Also, the molecular connection for the complexes was done to discover the most suitable orientation and configuration through snapshots and in the RDF or g(r) diagram, it was observed that the intensity of the peaks for the complex state is slightly lower than the free state, which is due to the removal of water molecules from the cavity and the replacement of methotrexate in the mct cavity with a ratio of 1:1. It was also observed in the SASA diagram that the complexation of methotrexate with
monochlorotriazinyl beta-cyclodextrin increases the accessible surface for solvent molecules due to having 3 monochlorotriazinyl substitutions. It can also be concluded from the RMSD diagrams and hydrogen bonds that the presence of methotrexate stabilizes the complexes. Also, the complexes have a more negative van der Waals interaction energy than the electrostatic interaction energy, which among the different mct isomers, the fourth isomer with van der Waals interaction energy and electrostatic interaction energy (-185.65 kJ/mol and -55.03 kJ/mol, respectively) It has better binding and stronger hydrogen bonds with mtx.
استاد راهنما :
محمد ديناري
استاد مشاور :
عليرضا نجفي چرمهيني
استاد داور :
حسين فرخ پور , حسين توكل
