پديد آورنده :
ميرچناري، مهدي
عنوان :
رديابي و تعيين خصوصيات مولكولي عوامل فايتوپلاسمايي انگور در منطقه مركزي ايران
مقطع تحصيلي :
كارشناسي ارشد
گرايش تحصيلي :
بيماري شناسي گياهي
محل تحصيل :
اصفهان: دانشگاه صنعتي اصفهان، دانشكده كشاورزي
صفحه شمار :
هفده،122ص.: مصور،جدول،نمودار
يادداشت :
ص.ع.به فارسي و انگليسي
استاد مشاور :
محمدزكي عقل
توصيفگر ها :
گروه﴿ Stolbur group (16SrXII , گونه Ca.Phytoplasma solani , آناليز PCR-RFLP , تعيين توالي نوكلئوتيدي
تاريخ نمايه سازي :
20/3/93
استاد داور :
مسعود بهار، سيروس قبادي
چكيده فارسي :
چكيده فايتوپالسماها به عنوان يكي از مهمترين عوامل ايجادكننده بيماري در روي گياهان خسارات فراواني به انگور در سراسر جهان وارد ميكنند طي سالهاي اخير در مناطق مركزي ايران عالئم پيچيدگي زردي و ارغواني شدن برگ درختان مو مشاهده شد كه با عالئم بيماريهاي فايتوپالسمايي شباهت داشت به منظور شناسايي و گروهبندي فايتوپالسماهاي آلودهكننده انگور منطقه مركزي ايران نمونههايي با عالئم فايتوپالسمايي جمعآوري شد و استخراج DNA از رگبرگ نمونهها صورت گرفت براي رديابي فايتوپالسما در نمونهها از واكنش PCR با جفت آغازگرهاي عمومي ناحيه 16S rRNA فايتوپالسماها استفاده شد به اين منظور در واكنش PCR دور اول جفت آغازگرهاي 7 P1 P و P1A P7A استفاده شدند با استفاده از آغازگر 7 P1 P در تعداد محدودي از نمونهها قطعه 4871 bp تكثير شد ولي استفاده از آغازگر P1A P7A منجر به تكثير قطعه 4872 bp در تعداد بيشتري از نمونهها شد براي تكثير نواحي مشخصي از قسمت داخلي ناحيه 16S 23S rRNA تكنيك Nested PCR با استفاده از جفت آغازگر 2 R16F2n R16R به كار گرفته شد استفاده از جفت آغازگر 2 R16F2n R در Nested PCR بعد از PCR دور اول با جفت آغازگرهاي 7 P1 P و P1A P7A منجر به تكثير قطعه 4922 bp در تعداد زيادي از نمونههاي جمعآوري شده در اواخر تابستان و اوايل پاييز شد ولي تكثير قطعه مورد نظر در نمونههاي بهاره و اوايل تابستان موفقيتآميز نبود براي بررسي بيشتر اين نمونهها از جفت آغازگرهاي 3 PA2F R fUu5 rU و NPA2F R در Nested PCR از محصول PCR جفت آغازگر P1A P7A استفاده شد استفاده از جفت آغازگرها 3 PA2F R fUu5 rU و NPA2F R در نمونههاي مثبت منجر به تكثير قطعات 788 bp 4487 bp و 177 bp شد بر اساس اين نتايج استفاده از جفت آغازگرهاي 3 PA2F R fUu5 rU و NPA2F R براي رديابي فيتوپالسماي انگور مناسب تشخيص داده شد ولي تركيب جفت آغازگر P1A P7A در PCR دور اول و 2 R16F2n R در دور دوم بهترين روش براي رديابي فايتوپالسماهاي انگور ارزيابي گرديد به منظور شناسايي جدايههاي عامل بيماري در نمونههاي انگور جمعآوري شده از آزمون PCR RFLP استفاده شد به اين منظور يك قطعه 4922 bp با استفاده از جفت آغازگر 2 R16F2n R در واكنش Nested PCR در جدايههاي مختلف تكثير شد و سپس اين قطعه توسط آنزيمهاي برشي Hea Rsa Msp Hap Mse Hinf و Taq مورد هضم آنزيمي قرار گرفت بر اساس اين آزمون جدايههاي فايتوپالسمايي در دو گروه و طبقهبندي شدند بر اساس آزمون PCR RFLP ده جدايه از مناطق گهرود سامان و فرخ شهر استان چهارمحال وبختياري تيران و شهرضاي استان اصفهان مالير استان همدان و مروست استان يزد به عنوان نماينده براي تعيين توالي نوكلئوتيدي انتخاب گرديدند مقايسه تواليهاي نوكلئوتيدي اين جدايهها با تواليهاي موجود در بانك ژن نشان داد كه جدايههاي مورد مطالعه داراي بيش از 22 يكنواختي با توالي گونه Candidatus Phytoplasma solani ثبتشده در بانك ژن ميباشند رسم درخت تبارزايي به روش Neighbor joining با 11110 تكرار مشخص نمود كه جدايههاي فايتوپالسمايي متعلق به گروه Stolbur group 16SrXII ازگونه Ca Phytoplasma solani ميباشند با توجه به گزارش گونه Ca Phytoplasma solani از روي ميزبانهاي ديگر در مركز ايران احتما ناقل مشتركي در گسترش اينگونه فايتوپالسمايي نقش دارد ال كلمات كليدي انگور گروه Stolbur group 16SrXII گونه Ca Phytoplasma solani آناليز PCR RFLP تعيين توالي نوكلئوتيدي هجده
چكيده انگليسي :
003 Living with genome instability the adaptation of phytoplasmas to diverse environments of their insect and plant host J Bacteriol 188 3682 3696 15 Barbara D J A Morton M F Clark and D L Davies 2002 Immunodominant membrane proteins from two phytoplasma in the aster yellows clade chlorante aster yellows and clover phyllody are highly divergent in the major hydrophilic region Microbiology 148 157 167 16 Bellardi M M G Bennis S Paltrinieri and A Bertaccini 2007 A sever disease include by candidates phytoplasma asteris in digitalis lanta Bull Insectol 12 673 689 17 Berges R M Rott and E Seemuller 2000 Range of Phytoplasma concenteration in various plant hosts as determined by competitive chain polymerase reaction Phytopathology 90 1145 1151 18 Bertaccini A and B Duduk 2009 Phytoplasma and phytoplasma diseases a review of recent research Phytopathol Mediterr 48 355 378 19 Bertaccini A 2007 Phytoplasmas diversity taxonomy and epidemiology Front Biosci 12 673 689 20 Botti S and A Bertaccini 2003 Variability and Functional rol of chromosomal sequences in 16SrI B subgroup phytoplasma including aster yellows and related strains Appl Microbiol 94 103 110 21 Boudon Padieu E 2003 The situation of Grapevine yellows and current research directions distribution diversity vectors diffusion and control 14th Meeting of the ICVG Locorotondo Italy Extended abstracts session 3 47 53 22 Bressan A D Clair O Semetey and E B Padieu 2005 Effect of two strains of Flavesence doree phytoplasma on the survival and fecundity of expremental leafhopper vector Euscelidius variegates Kirschbaum J Invertebr Pathol 89 144 149 23 Bulgari U P Casati P Crepaldi D Daffonchio F Quaglino L Brusetti and P A Bianco 2011 Restructuring of Endophytic Bacterial Communities in Grapevine Yellows Diseased and Recovered Vitis vinifera Appl Environ Microb 77 5018 5022 24 Carginale V G Maria C Capasso E Ionata F La Cara M Pastore A Bertaccini and A Capasso 2004 Identification of genes expressed in response to Phytoplasma infection in leaves of Prunus armeniaca by mRNA differential display Gene 332 29 34 25 Chang C J 1998 Pathogenicity of aster yellows phytoplasma an spiroplasma citri on periwinkle Phytopathology 88 1347 1350 26 Choi Y H E Casas Tapias K Kim J Verhoven J Brzin J Zel and R Verpoorete 2004 Metabolic discrimination of Catharantus roseus leaves infected by phytoplasma using H NMR spectroscopy and multivariate data analysis Plant Physiol 135 2398 2410 27 Christensen N M M Nicolaisen M Hansen and A Sshulz 2004 Distribution of phytoplasmas in infected plants as revealed by Real Time PCR and bioimaging Mol Plant Microbe Interact 17 1175 1184
استاد مشاور :
محمدزكي عقل
استاد داور :
مسعود بهار، سيروس قبادي
