عنوان :
ارزيابي تنوع ژنتيكي بين و درون توده هاي مختلف اسپرس ايراني ﴿Onobrychis vicifolia﴾ با استفاده از نشانگر SRAP
مقطع تحصيلي :
كارشناسي ارشد
گرايش تحصيلي :
بيوتكنولوژي كشاورزي
محل تحصيل :
اصفهان:دانشگاه صنعتي اصفهان، دانشكده كشاورزي
صفحه شمار :
يازده،54ص.: مصور،جدول
يادداشت :
ص.ع.به فارسي و انگليسي
استاد راهنما :
مجيد طالبي، بدرالدين ابراهيم سيد طباطبايي
استاد مشاور :
محمد مهدي مجيدي
تاريخ نمايه سازي :
94/1/16
استاد داور :
مهدي رحيم ملك، امير مساح
چكيده فارسي :
3 چكيده اسپرس Onobrychis vicifolia L گياهي چندساله و از خانواده بقوالت بوده و ايران يكي از مهمترين مراكز تنوع جنس اسپرس به شمار ميرود با وجود اهميت اين گياه در مراتع ايران با اين حال تحقيقات بر روي تودههاي بومي اسپرس در كشور محدود و عمدتا به صورت منطقهاي صورت گرفته است بررسي تنوع ژنتيكي تودههاي مختلف گياه اسپرس ميتواند در حفظ ذخاير ژرمپالسم اين گياه و كمك به برنامههاي اصالحي موثر باشد استفاده از نشانگرهاي مولكولي ميتواند در بررسي تنوع ژنتيكي تودههاي مختلف گياه اسپرس كمك موثري نمايد بر همين اساس در اين تحقيق ازنشانگر مولكولي SARP كه تركيبي از سادگي قابليت اطمينان باال پوشش متوسط سرتاسري ژنوم و با قابليت تكثير نواحي كد كننده در ژنوم است استفاده شد تعداد 73 توده مختلف گياه اسپرس متعلق به چهار گونه O vicifolia تعداد 13 توده O vicifolia تعداد يك توده O vicifolia تعداد يك توده و O vicifolia تعداد يك توده از مناطق مختلف كشور جمعآوري گرديد و پس از استخراج DNA از برگ تازه و تعيين كميت و كيفيت DNA استخراج شده در واكنشهاي PCR استفاده گرديد از مجموع 33 تركيب آغازگري مورد استفاده 88 نوار حاصل شد كه از اين تعداد 17 نوار 53 28 درصد چندشكل بودند ميانگين مقدار 54 3 PIC نشان دهنده قدرت مناسب نشانگر SRAP در بررسي تنوع ژنتيكي در گياه اسپرس ميباشد در بررسي تنوع ژنتيكي بين تودهها دامنه فاصله ژنتيكي بين تودههاي مورد مطالعه بين 423 3 و 341 3 بدست آمد از نظر پراكنش استاني تودهها كمترين فاصله ژنتيكي بين تودههاي مربوط به كشور روسيه كدهاي P و Q و بيشترين فاصله ژنتيكي بين تودههاي مربوط به مناطق دماوند و نجفآباد كدهاي G و M محاسبه گرديد مقدار عددي 11 3 بدست آمده براي جريان ژني بين گروهها Nm نشان داد كه در جمعيتهاي مورد مطالعه جريان ژني وجود دارد ولي اين جريان تا حدي نيست كه بتواند موجب همگن شدن جمعيتها شود دامنه ميزان شاخص اطالعات شانون براي تركيبات آغازگري بين 31 3 تا 25 3 محاسبه گرديد در تجزيه خوشهاي دادههاي SRAP دندوگرام ترسيم شده با استفاده از نرمافزار NTSYS sp Ver 2 02e نتوانست ژنوتيپهاي مورد استفاده در اين تحقيق را در گروههاي جداگانه قرار دهد به عبارت ديگر اختالط تودهها در يكديگر نشان دهنده تنوع ژنتيكي اندك بين تودهاي ميباشد تجزيه هماهنگ اصلي نيز نشان داد كه سه مولفه اول در مجموع 326 54 درصد از كل تغييرات را توجيه ميكنند بنابر اين روش تجزيه خوشهاي به عنوان بهترين روش براي ارزيابي تنوع ژنتيكي بين تودههاي اسپرس با استفاده از دادههاي SRAP ميباشد كلمات كليدي اسپرس تنوع ژنتيكي نشانگر Onobrychis vicifolia SRAP
چكيده انگليسي :
55 Assessment of Genetic Diversity among and within Iranian Sainfoin Onobrychis vicifolia Landraces using SRAP Marker Mohammad Beygi m beygi@ag iut ac ir 21 September 2014 Depatment of Agricultural Biotechnology Isfahan University of Technology Isfahan 84156 83111 IranDegree M Sc Language PersianM Talebi mtalebi@cc iut ac irB E Sayed Tabatabaei sayedt@cc iut ac irAbstractThe Sainfoin Onobrychis vicifolia is perennial herbs of the legume family Fabaceae and is one of the most important forage legumes Iran is one of the most importantcenters for genetic diversity of onobrychis Due to the fact that the sainfoin as a foragecrop plays an important role in the poroduction of forage in Iran pastures nevertheless studies on sainfoin landraces in the country is limit and mainly has been made locally Assessment of genetic diversity in different sainfoin landraces can keep these plantgermplasm resources and contribute to effective correctional programs Estimate ofgenetic diversity in the genetic composition of plants and also determines therelationship between species plays an important role in understanding and managing thenatural variation within the plant species The use of molecular markers can help toassessment of genetic variation in different sainfoin landraces So in this study we usedSRAP molecular marker as a simple reliable entire throughput of genome and targetingof coding secuences For evaluation of genetic diversity among 17 different masses ofonobrychis werw collected from different region of Iran Genomic DNA was extractedfrom fresh leaf samples and PCR reaction performed following measurment of qualityand quantity of extracted DNA Out of 10 primer combinations 88 bands was created of which 73 82 95 were polymorphic Average amount of PIC 0 45 representssuitable power of SRAP marker to determine genetic diversity in sainfoin In theassessment of genetic diversity among masses the genetic distance among masses wasstudied between 0 124 and 0 349 In the provincial distribution of masses the lowestand highest genetic distance was calculated between masses of Russia P and Q cods and Damavand and Najaf Abad regions G and M cods respectively Numerical valueof 1 33 obtained for gene flow between grouos Nm showed that there is gene flow inpopulation but this current can not lead to homogenization of the population Theshanon information index was calculated for primer compositions between 0 31 and0 52 In The cluster analysis of SRAP data drawed dendogram with NTSYS sp Ver2 02e could not classify masses in different groups In other word commixture ofmasses in the dendogram showed that there is not any genetic diversityamong species Principal coordinate analysis PCoA of SRAP data showed that sum of first three PCscolud be represented 45 629 of the total variation therfor the cluster analysis is thebest method for evaluation of genetic diversity aong sainfoin landraces Key Words SRAP genetic diversity sainfoin
استاد راهنما :
مجيد طالبي، بدرالدين ابراهيم سيد طباطبايي
استاد مشاور :
محمد مهدي مجيدي
استاد داور :
مهدي رحيم ملك، امير مساح
