پديد آورنده :
مهرپرور، مسعود
عنوان :
شناسايي مورفولوژيك و مولكولي و بررسي تنوع ژنتيكي سوسك هاي پوست خوار درختان سوزني برگ اصفهان
مقطع تحصيلي :
كارشناسي ارشد
گرايش تحصيلي :
حشره شناسي
محل تحصيل :
اصفهان: دانشگاه صنعتي اصفهان، دانشكده كشاورزي
صفحه شمار :
چهارده، 109ص.: مصور
استاد راهنما :
جهانگير خواجه علي، غلامرضا صالحي جوزاني
توصيفگر ها :
پوست خوار مديترانه اي كاج , فيلوژني , COX1 , 16SrDNA
استاد داور :
مجيد طالبي، نفيسه پورجواد
تاريخ ورود اطلاعات :
1394/12/01
چكيده فارسي :
4 چكيده سوسك هاي زير خانواده Scolytinae از مهم ترين آفات درختان ميوه و جنگلي مي باشند كه به طور عمده به درختان ضعيف و تحت تنشهاي محيطي حمله كرده و ممكن اسات خساارات زيادي وارد كنند يكي از مهم ترين پوسات خوارهاي درختان كاج در كشاور پوست خوار مديترانهاي كاج با نام علمي Orthotomicus erosus ميباشااد اين گونه از نظر مورفولوژي با داشااتن چهار خار انتهايي در قساامت انتهاي بالخوش كه دومين دندانه آن پهن با حاشايه صاف و گرد ميباشد از ساير گونه ها تفكيك مي ش ود تجاي ه و تحليل دياناي ميتوكندريايي اطالعات مهمي در مورد تنوع ژنتيكي جمعيتهاي حشاارات فراهم مي كند به منظور شااناسااايي مولكولي و بررسااي تنوع ژنتيكي اين گونه جمعيتهاي سااوسااك پوسااات خوار مديترانهاي كاج از اصااافهان و ديگر شاااهرها جمعآوري و ناحيه 881 جفت بازي ژن 1 COX و ناحيه 282 جفت بازي ژن 16S rDNA آن ها تكثير و توالي يابي شااد براي اسااتخراج DNA نمونهها از روش CTAB اسااتفاده شااد نتايج درخت فيلوژني با روشهاي اتصااال همساايه و حداكثر صارفه جويي نشان داد كه فاصله و تنوع كمي بين جمعيت ها وجود دارد و از طرفي درخت فيلوژني توانست تا حدودي نمونهها را از نظر منشاا از همديگر جداكند موقعيت قرارگيري نمونههاي ايران با جنس Orthotomicus مطابقت دارد و حالت مونوفيليك با گونههاي ديگر اين جنس مانند O caelatus و سااااير جنسها مانند Xylosandrus germanus را ندارد نتايج سااااعت مولكولي نشاااان داد رابطه بين جمعيتهاي مورد بررساي قدمتي كمتر از 4 1 ميليون سال دارد و زمان زيادي از جدايي آن ها نسبت به هم نميگ رد فاصله ژنتيكي درونگونهاي مشاهده شده به طور كامل با تنوع درونگونه اي در بين ساير حشرات سازگار و براي هر دو ژن فاصله ژنتيكي بينگونهاي بيشتر از درونگونهاي بود و دربعضاي موارد با يكديگر حالت هم پوشااني داشات براي ژن 1 COX كمترين فاصله ژنتيكي 211 1 و بيشترين فاصله ژنتيكي 414 1 و براي ژن 16S rDNA كمترين فاصااله ژنتيكي صاافر و بيشااترين فاصااله ژنتيكي 522 1 بدساات آمد آناليا توزيع عدم تطاب براي هر دو ژن براي جمعيت هاي مورد بررساي نتايج مشاابهي نشاان داد و نمودار منحنيها نرمال نبود با اين حال مطاب با گساترش جمعيت از جمعيتهاي كوچك بود پارامترهاي اسااساي تنوع ژنتيكي شااامل تعداد هاپلوتايپ ها تنوع هاپلوتايخي تنوع نوكلئوتيدي تعداد ساايتهاي پلي مورف و ميانگين تفاوتهاي نوكلئوتيدي دوبهدو MPD براي هر دو ژن مورد مطالعه محاسابه شااد نتايج همرديفساازي داده ها به ترتيب 22 و 444 موقعيت در سااايتهاي قرارگيري بازهاي آلي DNA براي 1 COX و 16S rDNA نشاااان داد براي ژن 1 COX مقدار تنوع ژنتيكي 21 1 تاجيما 948 1 فو 418 1 و براي ژن 16S rDNA مقدار تنوع ژنتيكي 61 1 تاجيما 57 4 فو 748 4 محاساابه شااد كه نشاااندهنده اثر گسااترش اخير جمعيتي سااوسااك پوساات خوار كاج در ايران و يا اثر انتخاب طبيعي جهتدار بر روي اين ژنها و در تعادل بودن روندهاي جهش رانش ژنتيكي در طول تكامل اسات از ميان دو ژن ميتوكندريايي اسااتفادهشاده 54 هاپلوتايپ مربوط به ژن 1 COX و 14 هاپلوتايپ در ژن 16S rDNA مشاااهده شااد مقدار تنوع هاپلوتايخي مربوط به ژن 1 4 111 COX و مربوط به ژن 1 991 16S rDNA برآورد شااد در نتيجه ژن 16S rDNA بيشااترين مقادير تنوع ژنتيكي را نشاانداد و در نتيجه در بررساي ساطوح تنوع ژنتيكي جمعيت هاي اين گونه از شاايساتگي باالتري نسابت به ژن 1 COX برخوردار است واژگان كليدي پوساااتخوار مديترانه اي كاج تنوع ژنتيكي فيلوژني 1 Orthotomicus 16S rDNA COX erosus
چكيده انگليسي :
441Morphological and Molecular Identification and Evaluation of GeneticDiversity of Bark Beetles Scolytinae on Coniferous Trees in Isfahan Masoud Mehrparvar Mehrparvar masoud@yahoo com January 13 2016 Department of Plant Protection Isfahan University of Technology Isfahan 84156 83111 IranDegree M Sc Language FarsiSupervisor khajeali@cc iut ac irAbstractBark beetles of Scolytinae subfamily are known as one of the most important pests on horticultural andforest trees which mainly attack the weak and under environmental tensions trees and may cause so manydamages to the trees The Mediterranean pine bark beetle Orthotomicus erosus is one of the mostdestructive bark beetles of pine trees in Iran This species can be distinguished morphologically from theother species in most regions by four ending protrusions at the terminal section of its elytra which thesecond spine is wide with smooth and round edge The analysis of mitochondrial DNA provides importantinformation about the genetic diversity of insect populations For molecular identification and geneticdiversity analysis of O erosus several populations were collected from Isfahan and other regions in Iranand a 488 base pair region of COXI and a 383 base pair region of 16S rDNA were PCR amplified andsequenced applied CTAB method was used to extract the samples DNA The phylogenetic treeconstructed using Neighbor joining and Maximum Parsimony showed a little distance and diversity amongthe populations Furthermore the phylogenetic tree could somehow separate the samples given to theirsources Locating positions of Iranian samples meet the Orthotomicus and does not have monophyletic casewith the other congeneric species such as O caelatus and heterogeneric species such as Xylosandrusgermanus The Molecular clock results showed that the relationship among the analysed populations datesback to less than 0 1 million years ago and it does not pass a long time from their separation from eachother The observed intraspecific genetic distance was completely compatible with the distance among otherinsects Interspecific genetic diversity was higher than the intraspific diversity in both genes and in somecases they overlapped The minimum and maximum genetic distance for COXI gene and 16S rDNA genewere 0 0 235 and 00 2 0 101 respectively The mismatch distribution analysis for both genes in thetested populations showed the same results the curves did not show normal distribution however it wascompatible to population expansions from small populations The main genetic diversity parametersincluding haplotypes numbers haplotypes diversity nocleotic diversity polymorphism site numbers andthe pair nucleotide diversity mean MPD for the both given genes were calculated The o rdering andarrangement results showed 23 and 111 locations in positioning sites of DNA organic bases for COXI and16S rDNA The genetic diversity of 0 03 Tajima 0 819 Fu s 0 801 were calculated for COXI gene while the genetic diversity of 0 06 Tajima 1 75 and Fu s 1 817 were calculated for 16S rDNA that shows therecent development of bark beetle populations in Iran or the natural selection effect on these gene and onthe balanced genetic mutation drift process along the development From the both used mitocondrial gene 15 haplotypes were related to COXI gene and 14 haplotypes were observed in 16S rDNA The haplotypediversity related to the COXI gene and the 16S rDNA gene were obtained 1 000 and 0 990 repectively Inconclusion 16S rDNA gene showed a higher genetic diversity and as a result is more competent rather thanthe COXI gene in analysing the genetic diversity levels of these sp ecies populations Keywords Mediterranean pine bark beetle Genetic diversity Phylogeny COX1 16SrDNA Orthotomicus erosus
استاد راهنما :
جهانگير خواجه علي، غلامرضا صالحي جوزاني
استاد داور :
مجيد طالبي، نفيسه پورجواد
