ساخت شبكه هاي تعامل قابل اطمينان با استنتاج فازي و شناسايي كمپلكس هاي پروتئيني

چكيده فارسي :

چكيده بيوانفورماتيك علم نويني است كه در آن سعي ميشود با بهكار گيري از كامپيوترها و نرمافزارهاي تخصصي و بانكهاي اطالعاتي به مسائل بيولوژيكي مخصوصا در زمينهي مولكولي و سلولي پاسخ دهد يكي از حوزههاي كاري بيوانفورماتيك شناسايي كمپلكسهاي پروتئيني است كمپلكسهاي پروتئيني گروهي از پروتئينها هستند كه با همكاري يكديگر فعاليت خاصي را در سلول موجود زنده انجام ميدهند در اين حوزه طراحي الگوريتمي كه بهتوان اين گروهبندي را بر روي پروتئينها انجام دهد مورد توجه قرار گرفتهاست الگوريتمهاي ارائه شده در اين حوزه كمپلكسهاي پروتئيني را از روي گرافهاي ساخته شده از شبكههاي تعاملي شناسايي ميكنند دستهاي از اين روشها بر روي گرافهاي وزندار و دستهاي ديگر بر روي گرافهاي بيوزن اعمال ميشوند متاسفانه مطالعات روي شبكههاي تعاملي نشان ميدهد كه بيشتر از 29 اين تعاملها مثبت كاذب هستند از اينرو يك ديدگاه كلي به منظور افزايش دقت در تشخيص كمپلكسهاي پروتئيني تعيين وزن براي هر تعامل به كمك دادههاي زيستي و به منظور ساخت شبكهي تعاملي قابل اطمينان است در اين پژوهش براي ساخت شبكهي قابل اطمينان از منابع زيستي مختلفي استفاده شدهاست با توجه به اينكه همهي دادههاي زيستي داراي خطا ميباشند ميتوان با بهرهگيري دقيق از منابع مختلف و ادغام آنها با استفاده از منطق فازي خطاهاي منابع را شناسايي و تأثير آنها را در تشخيص كمپلكسهاي پروتئيني كمرنگ كرد همچنين الگوريتم كلي براي شناسايي كمپلكسهاي پروتئيني با بهره جستن از نقاط قوت ساير الگوريتمها و فرضيات موجود در مورد كمپلكسهاي واقعي ارائه شدهاست در نتيجه روش پيشنهادي روي مجموعه دادههاي Collin Gavin Krogan و DIP اعمال شد و Precision روي آنها به ترتيب 92 2 32 2 26 2 72 2 و F measure به ترتيب 26 2 16 2 12 2 86 2 بهبود يافت كلمات كليدي كمپلكسهاي پروتئين شبكههاي تعاملي پروتئين پروتئين شباهت زيستي شباهت توپولوژيكي رايگيري فازي سيستم فازي نوع دوم بازهاي

مهرانفر، عادله

ساخت شبكه هاي تعامل قابل اطمينان با استنتاج فازي و شناسايي كمپلكس هاي پروتئيني

شباهت زيستي , شباهت توپولوژيكي , راي گيري فازي , سيستم فازي نوع دوم بازه اي