پديد آورنده :
آقاسي، مائده
عنوان :
شناسايي عوامل باكتريايي پوسيدگي سوخ پياز دراستان اصفهان
مقطع تحصيلي :
كارشناسي ارشد
گرايش تحصيلي :
بيماري شناسي گياهي
محل تحصيل :
اصفهان: دانشگاه صنعتي اصفهان، دانشكده كشاورزي
صفحه شمار :
دوازده،94ص.: مصور، جدول، نمودار
يادداشت :
ص. ع. به فارسي و انگليسي
استاد راهنما :
مسعود بهار
توصيفگر ها :
پياز , پوسيدگي نرم , BOX-PCR , Burkholderia gladioli , Pectobacterium sp , Dickeya sp
استاد داور :
امير مساح، بدرالدين ابراهيم سيد طباطبايي
تاريخ ورود اطلاعات :
1396/02/09
چكيده فارسي :
5 چكيده پياز مهمترين گونهي اقتصادي و خوراكي خانوادهي Liliaceae ميباشد كه به طور وسيعي در سطح جهاني كشت ميشود در بين بي ماري هاي مهم پ ياز بي ماري هاي باكتر يايي نظير پوسددد يدگي نرم پكتو باكتريومي Pectobacterium carotovorum subsp carotovorum پو سيدگي نرم ديكيايي Dickeya chrysanthemi و لغزان پو ستي پياز Burkholderia gladioli از انت شار جهاني بيشتري برخوردارند در سالهاي اخير بيماري پوسيدگي نرم پياز موچب خسارت زيادي به اين محصول در بسياري از مزارع ا ستان ا صفهان شده ا ست از عالئم زردي و پژمردگي ق سمتهاي هوايي و پو سيدگي نرم سوخ پياز در مزرعه و طي مراحل پس از بردا شت چنين ا ستباط شد كه احتماال عوامل اين بيماريهاي مهم باكتريايي با شند به منظور ت شخيص و شنا سايي عوامل بيمارگر فريدن فالورجان و قهدريجان و باكتريايي احتمالي اين بيماري از نمونهي پياز هاي واجد عالئم پوسددديدگي نرم در مزارع مختل مغازهها نمونهبرداري شددد از كشددت نمونههاي مزبور در محيط كشددتهاي اختصدداصددي و عمومي 75جدايهي باكتري بدسددت آمد با بكارگيري روش rep PCR با اسدددتفاده از آغازگر BOX1AR به طور متوسدددط چهار قطعه ودر اندازههاي 112 تا 1115 جفت بازي الگوي بااندي حاصددل جدايههاي جمع آوري شددده در دو گروه I و II طبقه بندي گرديند د د ميان نمونهها تكثير يافت كه بر اسددا د جدايههاي باكتريايي گروه I بر ا سا م شخ صات كلني خ صو صيات بيماريزايي بيو شيميايي و فعاليت پكتواليتيكي به دو زيرگروه Ia و Ib تق سيم شدند اع ضاي زير گروه Ia شامل 73 جدايه از 75 جدايه بودندكه به دليل واكنش مثبت ف سفاتاز توليد ايندول و اسديد از قندهاي الكتوز و مانيتول عدم احيا مواد از سداكارز و عدم هضدم قندهاي تري هالوز آلفامتيل دي گلوكوزيد دالسديتول و سددوربيتول به عنوان Dch D chrysanthemi شددناخته شدددند تعداد 55 جدايه ديگر به گروه Ib تعلق داشددتند كه به لحاب بعضددي خصددوصدديات بيوشدديميايي مانند توليد اسدديد از الكتوز و عدم توليد فسددفاتاز ايندول و احياس مواد از سدداكارز به عنوان زير گونه P Pcc carotovorum subsp carotovorum شددناسددايي گرديدند به منظور تاييد تشددخيص گونهها از واكنش زنجيرهاي پليمراز اسددتفاده شددد طي واكنش PCR با بكارگيري جفت آغازگر 2 Y1 Y يك قطعهي 434 نوكلئوتيدي و با اسددتفاده از جفت آغازگر د د د ExpccF ExpccR يك قطعهي 155 نوكلئوتيدي در جدايه هايي كه به عنوان Pcc معرفي شدددده بودند تكثير يافت كه توالي قطعه 155 نوكلئوتيدي با توالي جدايه هاي Pcc در بانك ژني 63 شددباهت داشددت جدايههايي كه به عنوان Dch معرفي شدددند با جفت آغازگرهاي 2 ADE1 ADE و pelZ 1 F pelZ 1 R به ترتيب قطعهي 124 و 3625 نوكلئوتيدي را تكثير نمودند كه توالي قطعه 124 بازي با جدايه هاي Dch در بانك ژن تا 73 شباهت دا شت با بكارگيري جفت آغازگر 1 G1 L نواحي ITS جدايههاي Pcc و Dch كامال متمايز شددند جدايههاي ياكتريايي گروه II متعلق به نمونههاي سدوخ پياز پس از برداشدت بودند كه روي محيط آگار د د د غذايي NA كلنيهاي زرد مايل به قهوهاي چروكيده و با حاشددديه ناصدددان داشدددتند با انجام آزمونهاي بيماريزايي و بيوشددديميايي مشددخص شددد كه اين جدايهها متعلق به باكتري Burkholderia gladioli هسددتند جدايههاي مزبور با جفت آغازگر اختصدداصددي 2 61 CMG 16 1 CG در واكنش PCR يك قطعه 864 بازي تكثير نمودند كه توالي يابي نوكلئوتيدي اين قطعه نيز تعلق آنرا به B gladioli تاييد نمود با توجه به نتايج به د ست آمده م شخص گرديد كه دو باكتري P carotovorum subsp carotovorum و D chrysanthemi عوامل اصددلي پوسدديدگي نرم پياز در مزرارع اطران اصددفهان ميباشددند و باكتري B gladioli در پوسدديدگي سوخ پياز در مرحله پس از برداشت دخالت دارد كلمات كليدي پياز پوسيدگي نرم BOX PCR Dickeya sp Pectobacterium sp Burkholderia gladioli
چكيده انگليسي :
37 Identification of Bacterial Causal Agents of Onion Soft Rot in Isfahan Maedeh Aghasi m agh@ag iut ac ir 2017 Februrary 27 Department of Plant Protection Iran Isfahan 84156 83111 Isfahan University of TechnologyLanguage Farsi Degree M ScSupervisor M Bahar mbahar@cc iut ac irABSTRACTOnion is one of the most important economic and dietary crops belonging to Liliaceae that widely cultivatedin all over the world Among the important diseases of onion bacterial diseases such as Pectobactrium soft rot Pectobacterium sp Dickeya soft rot Dickeya chrysanthemi and slippery skin Burkholderia gladioli occurfrequently worldwide In recent years onion soft rot disease caused great damages in onion producing area ofIsfahan provinces Based on main symptoms of the diseases including yellowing and wilting of aerial parts andsoft rot of onion bulbs in farms and post harvest stages it was inferred that likely bacteria are the causal agentsof this important disease In order to identify and characterize bacterial causal agents of the disease samplingwas done from onion farms with soft rot symptom in Fereydan Flavarjan and Ghahderijan By culturing ingeneral and specific media 57 bacteral isolates were obtained from the collected samples Fingerprinting ofthe isolates by rep PCR method using BOX1AR primer generated four fragments in size of 200 to 1000 bpwith different band patterns Based on BOX banding patterns the isolates were differentiated into two groupsI and II According to morphological pathological and biochemical characteristic and also pectolytic activity the isolates of group I placed in two subgroup Ia and Ib The isolates of subgroup Ia including 37 of 57 isolates because of positive reaction of phosphatase indole and acid production from lactose mannitol and negativereaction for reducing substances from sucrose utilization of trehalose methyl D glucoside dulcitol andsorbitol characterized as D chrysanthemi Dch Other 11 isolates belonging to Ib group that in terms of somebiochemical characteristic such as acid production from lactose and lack of production phosphatase indole andreducing substances from sucrose identified as P carotovorum subsp carotovorum Pcc In order to ascertainspecies identification all isolates were used as template in PCR reactions Using species specific primer pairsY1 Y2 and ExpccF ExpccR amplified a 434 bp and 550 bp fragments in the isolates identified as Pcc Ib Theresults of sequencing of the latest fragment indicated 96 identity of isolates subgroup Ib with sequences ofGenBank isolates The isolates introduced as D chrysanthemi Ia amplified 420 and 1263 bp fragments byusing primer pairs ADE1 ADE2 and pelZ 1 F pelZ 1 R Nucleotide sequences and alignment of amplicon420bp with available sequences in GenBank determined 97 sequences similarity of subgroup Iarepresentetives with Dch isolates in GenBank Using primer pairs G1 L1 in PCR reaction ITS region ofisolates amplified and based on banding pattern they are placed in different two groups Bacterial isolates ofgroup II belonging to post harvest bulb onion samples produced yellow brown wrinkled and serrated marginscolonies in NA medium The results of pathogenicity and biochemical tests of group II isolates revealed thatthese isolates belong to Burkholderia gladioli Also these isolates amplified a 468 bp fragment in PCR reactionusing primer pairs CMG 16 1 CG 16 2 containing nucleotide sequences similar to B gladioli According tothe results of this study it was determined that P carotovorum subsp carotovorum and D chrysanthemi arecausal agents of onion soft rot in fields of Isfahan provinces and B gladioli is involved in onion bulb rot inpost harvest stages Key words onion soft rot Dickeya sp Pectobacterium sp Burkholderia gladioli BOXPCR
استاد راهنما :
مسعود بهار
استاد داور :
امير مساح، بدرالدين ابراهيم سيد طباطبايي
