پديد آورنده :
تاج بخت، پونه
عنوان :
بررسي تنوع ژنتيكي درون گونه اي گياه آنغوزه (Ferula assa-foetida) با استفاده از نشانگرهاي مولكولي SRAP و SCoT و ميزان محتواي فنولي كل
مقطع تحصيلي :
كارشناسي ارشد
گرايش تحصيلي :
بيوتكنولوژي
محل تحصيل :
اصفهان: دانشگاه صنعتي اصفهان، دانشكده كشاورزي
صفحه شمار :
نه، 77ص.: مصور، جدول، نمودار
يادداشت :
ص.ع. به فارسي و انگليسي
استاد راهنما :
مجيد طالبي، مهدي رحيم ملك
توصيفگر ها :
آنغوزه , تنوع ژنتيكي , نشانگر SCoT , نشانگر SRAP , كل محتواي فنولي
استاد داور :
جهانگير خواجه علي، احمد ارزاني
تاريخ ورود اطلاعات :
1396/07/10
چكيده فارسي :
1 چكيده آنغوزه Ferula assa foetida گياهي علفي كركدار چنـدسـاله و منوكارپيـك از خـانواده چتريـان ميباشد صمغ آلئورزيني اين گياه ازگذشتههاي دور كاربرد غذايي و دارويي فراوان دارد در طب سنتي آسيا صمغ ريشه آنغوزه به عنوان تنظيم سيستم هاضمه پاككننده و تحريككننده پرزهاي رودهاي كرمكش خلطآور ضد يبوست داروي مسكن و اشتهاآور تجويز ميشود خاستگاه آنغوزه استپهاي ايران و قسمتهايي از افغانستان با پراكندگي وسيع است عليرغم اهميت اقتصادي و دارويي اين گياه مطالعات مولكولي محدودي به منظور بررسي تنوع ژنتيكي آنغوزه صورت گرفته است در اين تحقيق براي تشخيص تنوع ژنتيكي درون گونهاي آنغوزه از نشانگرهاي مولكولي SCoT و SRAP كه نواحي بيان شونده ژنوم را مورد هدف قرار ميدهند استفاده گرديد نه آغازگر SCoT و نه تركيب آغازگري SRAP بر روي 46 ژنوتيپ آنغوزه به ترتيب 112 و 491 نوار تكثير كردند كه از اين ميان به ترتيب 70 69 و 78 29 چندشكلي نشان دادند ميانگين محتواي اطالعات چندشكل براي آغازگرهاي 0 446 SCoT و براي كل تركيبات آغازگرهاي 0 435 SRAP محاسبه شد تجزيه خوشه اي با استفاده از ضريب تشابه جاكارد و الگوريتم UPGMA با ضريب همبستگي كوفنتيك 18 0 براي نشانگر SCoT و 57 0 براي نشانگر SRAP انجام شد كه تا حدودي بيانگر تفكيك جمعيتهاي مختلف بود نتايج حاصل از نشانگر Fst 0 07224 SCoT و نشانگر Fst 0 09929 SRAP بيان كننده تنوع ژنتيكي و جريان ژني نسبتا باال در بين جمعيتهاست به اين ترتيب كه Nm در مورد نشانگر 3 21 SCoT و در مورد نشانگر 2 27 SRAP محاسبه گرديد مشاهده درصد تنوع زياد بين جمعيتها نشان دهنده وجود منبع ژرمپالسم غني جهت استفاده در برنامههاي اصالحي است از طرفي نتايج حاصل از بررسي ساختار جمعيتها با استفاده از نرم افزار Structure حاكي از تبادل ژنتيكي فراوان و اختالط جمعيتها ميباشد اين نتايج همه حاكي از آن هستند كه طبقهبندي ژنوتيپهاي آنغوزه مستقل از منشأ جغرافيايي آنها است عالوه بر اين به منظور بررسي و اندازهگيري ميزان كل تركيبات فنولي اين گياه ارزشمند از اسپكتوفتومتري و روش فولين سيوكالتيو استفاده شد و تنوع نسبتا گستردهاي 361 0 839 0 ميليگرم اسيد تانيك بر گرم ماده خشك گياه بين جمعيتها مشاهده گرديد همچنين آزمايش كروماتوگرافي مايع با كارايي باال HPLC با استفاده از استانداردهاي تركيبات فنوليك توانست هفت تركيب شاخص را در آنغوزه مربوط به شش منطقه تعيين نمايد اين تركيبات شامل گاليك اسيد آپيژنين كوئرستين لوتئولين فروليك اسيد كافئيك اسيد و كلروژنيك اسيد بود نتايج HPLC تنوع متوسطي 219 2 2000 0 ميليگرم در گرم ماده خشك در ميان نمونههاي آنغوزه مورد مطالعه از نظر ميزان تركيبات فنولي نشان داد به طور كلي نتايج حاصل از بررسي تنوع ژنتيكي ميتواند به انتخاب نوع نشانگر و ژنوتيپهاي خاص جهت برنامههاي اصالحي همچون انتخاب ژنوتيپهاي برتر از نظر محتواي فنولي و خاصيت آنتي اكسيداني كمك كند واژههاي كليدي آنغوزه تنوع ژنتيكي نشانگر SCoT نشانگر SRAP كل محتواي فنولي
چكيده انگليسي :
80Assessment of Genetic Diversity within Ferula assafoetida Populations Using SCoT and SRAP Molecular Markers and Total Phenolic Content Pooneh Tajbakht p tajbakht@ag iut ac ir August 02 2017 Department of Agricultural Biotechnology Isfahan University of Technology Isfahan 84156 83111 Iran Degree M Sc Language Farsisupervisor M Talebi Associate Prof mtalebi@cc iut ac ir M Rahimmalek Associate Prof mrahimmalek@cc iut ac irAbstractFerula assafoetida is an herbaceous perennial and monocarpic species of Apiaceae family The Ferulaoleoresinous gum has had various food and medicinal applications from past to now In traditional Asianmedicine the gum of assafoetida s root had been prescribing as the regulator of the digestive system cleaner and stimulator of intestinal villi anthelmintic expectorant laxative painkiller and appetizingmedication The origin of F assafoetida is the steppes of Iran and some parts of Afghanistan with anextended distribution Despite the economic and medicinal importance of this plant limited molecularstudies has been done to assess the genetic diversity of assafoetida In this study assessment of geneticdiversity within F assafoetida populations was done using SCoT and SRAP molrcular markers which targetexpressible regions of genome Nine SCoT primers and nine SRAP primer combinations was applied toassess the genetic diversity of 64 genotypes and amplified 211 and 194 bands which showed 96 07 and92 87 of polymorphism respectively In order to investigating of primers efficiency in discerning ofgenotypes polymorphic information content PIC was calculated and it was 0 446 for SCoT primers andwas 0 435 for SRAP primer combinations The dendograms generated from Jaccard s similarity matrix andthe UPGMA method revealed genetic relationships among the F assa foetida genotypes The highestcophenetic correlation coefficient of SCoT analysis was r 0 81 and the highest cophenetic correlationcoefficient of SRAP analysis was r 0 75 which relatively indicated the separation of populations Theanalysis also revealed a relatively acceptable differentiation in allele frequencies that was equal to Fst 0 09 in SCoT analysis and it was equal to Fst 0 07 in SRAP results which illustrated high geneticdiversity and gene flows among populations High percent of diversity among populations indicates a richresource of germplasm for breeding plans Besides the assessment of population structure demonstratedhigh rate of gene flows and mixture of populations and it seems that classification of F assafoetidagenotypes does not related to their geographical regions Moreover the total phenol composition wasassessed using spectrophotometry and folin ciocalteu method and a relatively extent variety 0 163 0 938milligram of tannic acid per gram of dry weight of plant was shown among populations In addition HPLCtest using standards of phenolic compositions defined seven index compositions related to sixgeographical regions consisting of Galic acid Apigenin Quercetin Luteolin Ferolic acid Coffeic acid and Cholorogenic acid The result of HPLC illustrated a medium variety of phenolic content 0 0002 2 912mg dry weight of plant among F assafoetida samples All in all assessment of genetic diversity couldhelp the selection appropriate markers and special genotypes for breeding plans like selection of greatestgenotypes in terms of total phenolic content and antioxidant activity Keywords Ferula assafoetida Genetic diversity SCoT marker SRAP marker Totalphenolic content
استاد راهنما :
مجيد طالبي، مهدي رحيم ملك
استاد داور :
جهانگير خواجه علي، احمد ارزاني