پديد آورنده :
نيكبخت بروجني، منصور
عنوان :
بررسي تنوع ژنتيكي گونه Bromus danthoniae با استفاده از نشانگرهاي ريزماهواره
مقطع تحصيلي :
كارشناسي ارشد
گرايش تحصيلي :
اصلاح نباتات
محل تحصيل :
اصفهان : دانشگاه صنعتي اصفهان
صفحه شمار :
دوازده، ۶۴ص.: مصور، جدول، نمودار
استاد راهنما :
احمد ارزاني، محمد مهدي مجيدي
استاد مشاور :
مهدي رحيم ملك
توصيفگر ها :
نشانگر مولكولي , تنوع ژنتيكي , چند شكلي , فاصله ژنتيكي , لاين خالص
استاد داور :
علي محمد مير محمدي ميبدي، بدرالدين ابراهيم طباطبائي
تاريخ ورود اطلاعات :
1397/11/24
تاريخ ويرايش اطلاعات :
1397/11/27
چكيده فارسي :
چکیده گونه Bromus danthoniae گراس مرتعی با قابلیت ر شد در دامنههای خ شک کوه ستانی و اقلیمهای خ شن بیابان ا ست به همین لحاظ از آن بعنوان گیاه د شوارپ سند ویژه مناطق بیابانی و حتی مناطق شور یاد شده ا ست با این وجود تاکنون مطالعه تنوع ژنتیکی نمونههای ایرانی این گونه از نظر نشانگرهای مولکولی انجام نگرفته است مطالعه حاضر با هدف ارزیابی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های B danthoniae جمع آوری شدددده از مناطق جغرافیایی شدددور و معمول غرب کشدددور با اسدددتفاده از نشدددانگرهای مولکولی ریزماهواره اجرا شدددد مواد گیاهی مورد اسدددتفاده در این مطالعه شدددامل 97 ژنوتیپ خالص B danthoniae بود که از مناطق غرب و شمال غرب ایران جمعآوری شده بود تنوع ژنتیکی موجود در ژنوتیپها با ا ستفاده از 21 ن شانگر چند شکل EST SSR و SSR برر سی شدند ابتدا هرکدام از آغازگرها از طریق واکنش زنجیرهای پلیمراز با DNA ی تعدادی از ژنوتیپهای متنوع از لحاظ جغرافیایی مورد آزمون قرار گرفته و در صورت وجود چندشکلی بر روی همه ژنوتیپها بکار گرفته شد نتایج نشان داد که آغازگرهای 21 Xtxp و 9 Xcfd موفقتر از سایر آغازگرها در تبیین فاصله ژنتیکی ژنوتیپهای مورد اسددتفاده در این تحقیق بودند متوسددط محتوای اطالعات چندشددکل PIC ایجاد شددده توسددط آغازگرهای مورد اسدددتفاده در این تحقیق 274 0 بود که میزان چندشدددکلی متوسدددطی را در میان ژنوتیپها ایجاد کردهاند براسدداس نمودار خوشدده بندی انجام شددده با نرمافزار 20 2 NTSYS pc با رویه Neighbour Joining براسدداس دادههای حاصل از نشانگر EST SSR و SSR با توجه به حداکثر فاصله بین گروهها شاخههای اصلی و عدم وجود اثر زنجیرهای در آن بازه تعداد هشت گروه تشکیل شد که با نتایج تجزیه به مختصات اصلی PCoA هماهنگی نسبتا خوبی داشت براساس ماتریس تشددابه ژنوتیپها دو ژنوتیپ NAG2 C و NAG6 C با ضددریب تشددابه 48 بیشددترین و دو ژنوتیپ URM11 D و ILA1 G با ضریب تشابه 71 کمترین شباهت را داشتند در گروهبندیهای حاصل تطابق ناقصی بین تنوع ژنتیکی و تنوع جغرافیایی یافت شد نتایج به د ست آمده از تجزیه به مخت صات ا صلی برای هردو ن شانگر EST SSR و SSR ن شان داد که پنج مؤلفه اول در مجموع 82 85 در صد کل تغییرات را توجیه نمودند در ن شانگرهای EST SSR و SSR میزان Fst برابر با 5350 0 بود که نشاندهنده تفاوت متوسطی بین گروههای مورد مطالعه بوده است نتایج تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که63 5 در صد از تنوع کل به بین گروههای جغرافیایی و 46 49 در صد آن به درون گروهها اخت صاص دا شته ا ست نتایج حاصدله از فواصدل ژنتیکی و ضدرایب تشدابه در نشدانگر EST SSR و SSR نشدان داد که بیشدترین شدباهت بین ژنوتیپهای د د د د د د د د آذربایجان غربی 51کیلومتری ارومیه E و آذربایجان غربی جاده مهاباد سددده راه نقده 59 0 C و کم ترین آن بین ژنوتیپهای آذربایجان غربی جاده مهاباد سدده راه نقده C و مریوان مرز ایران و عراق 27 0 O بود در گروهبندیهای حاصدددل ژنوتیپهای مورد مطالعه مربوط به یک منطقه جغرافیایی در یک گروه قرار نگرفتند و بعضدددا با ژنوتیپهایی هم گروه شدددند که متعلق به منطقه جغرافیایی دیگر بودند از جمله دالیل این امر میتوان به مهاجرت بذرهای این گیاه توسددط جانوران پرندگان و عوامل محیطی اشددداره کرد تنوع ژنتیکی باالی شدددناسدددایی شدددده بین و درون گروههای جغرافیایی و ژنوتیپهای Bromus danthoniae ن شان دهنده ژنوم غنی ژنوتیپهای بروموس در ایران ا ست از این منبع ژنتیکی غنی که سازگاری با محیطهای تنشدار بهویژه شوری خشکی و گرما دارد میتوان در راستای اصالح مولکولی گیاهان خویشاوند زراعی با اهمیت اقتصادی باال نظیر گندم و جو استفاده کرد کلمات کلیدی نشانگر مولکولی تنوع ژنتیکی چند شکلی فاصله ژنتیکی الین خالص
چكيده انگليسي :
Evaluation of genetic diversity of Bromus donthoniae using microsatellite markers Mansour Nikbakht Borojeni nikbakht1373@yahoo com January 6 2019 Department of Agronomy and Plant Breeding Isfahan University of Technology Isfahan 84156 83111 Iran Degree M Sc Language FarsiSupervisor Ahmad arzani a arzani@cc iut ac irSupervisor Mohammad mahdi majidi majidi@cc iut ac irAbstractBromus danthoniae is a rangeland grass with growth potential in mountainous slopes and harshdesert climates In this respect it is known as a tolerant plant which is suitable for desert areasand even saline areas However the genetic diversity in Iranian samples of this species has notbeen studied using molecular markers yet The present study was performed with the aim toevaluate the genetic diversity of B danthoniae genotypes collected from saline and non salineregions of the west of Iran using microsatellite markers The plant material used in this studyincluded 79 genotypes of B danthoniae which were collected from western and northwesternregions of Iran The genetic diversity of the genotypes was evaluated using 12 polymorphic EST SSR and SSR markers First each of the primers was tested through polymerase chain reactionby the DNA of some geographically distinct genotypes and then the polymorphic marker wasapplied on all genotypes if there was any polymorphism The results showed that Xtxp 12 andXcfd9 primers were more successful than other primers in explaining the genetic distance of thegenotypes used in this study The average Polymorphism Information Content PIC generatedby primers used in this study was 0 472 which produced moderate polymorphism among thegenotypes Based on the clustering diagram performed based on the data obtained from the EST SSR and SSR markers eight groups were obtained which had a fairly good agreement withprincipal coordinates analysis PCoA results Based on similarity matrix of genotypes twogenotypes NAG6 C and NAG2 C with the similarity coefficient of 84 had the most and twoURM11 D and ILA1 G genotypes with the similarity coefficient of 17 had the least similarity In the resulting classifications there was an incomplete correlation between genetic diversity andgeographical diversity The results obtained from the principal coordinates analysis for bothEST SSR and SSR markers showed that the first five components totally justify 58 28 of thetotal variation In the EST SSR and SSR markers the Fst value was 0 0535 indicating a moderatedifference between the studied groups The results of molecular variance analysis showed that5 36 of the total variation has been allocated among the geographical groups and 94 64 ofthem has belonged within the groups The results of genetic distances and similarity coefficientsin the EST SSR and SSR markers showed that the highest similarities were between WestAzarbaijan genotypes 15 km from Urmia E and West Azarbaijan Mahabad road Naghadeh 0 95 C and the lowest belonged to genotypes of West Azarbaijan Mahabad Road Naghadeh C and Marivan Iran Iraq border 0 72 O In the resulting classifications the studied genotypesthat belong to a geographical area did not include in one group and grouped along with genotypes 65
استاد راهنما :
احمد ارزاني، محمد مهدي مجيدي
استاد مشاور :
مهدي رحيم ملك
استاد داور :
علي محمد مير محمدي ميبدي، بدرالدين ابراهيم طباطبائي
