پديد آورنده :
قربانيان، مريم
عنوان :
شناسايي مولكولي و تعيين پراكنش ويروس هاي آبله آلو و لكه حلقوي گوجه فرنگي در درختان ميوه هسته دار استان اصفهان
مقطع تحصيلي :
كارشناسي ارشد
محل تحصيل :
اصفهان : دانشگاه صنعتي اصفهان
صفحه شمار :
ده، 81 ص.: مصور، جدول، نمودار
استاد راهنما :
امير مساح، صادق جلالي
توصيفگر ها :
درختان ميوه هسته دار , ويروس آبله آلو , ويروس لكه حلقوي گوجه فرنگي , اليزا , RT-PCR
استاد داور :
جهانگير خواجه علي، ابوذر سورني
تاريخ ورود اطلاعات :
1398/05/07
رشته تحصيلي :
مهندسي كشاورزي
تاريخ ويرايش اطلاعات :
1398/05/07
چكيده فارسي :
چکیده ایرن به دلیل داشتتتن شتترایل ایلیمی متنوی یکی از کشتتور های مهم در کشتتت وکار انوای درختان میوه به ویژه هستتتهدارها می باشد تاکنون ویروس های متعددی از هسته دارها در سراسر دنیا گزارش شده است ویروس های آبله آلو Plum pox virus PPV و لکه حلقوی گوجه فرنگی Tomato ringspot virus ToRSV از ویروس های مهم هسته دارها محسوب می شوند ویروس آبله آلو از خانواده Potyviridae و جنس Potyvirus دارای گسترش جهانی است و عامل بیماری شارکا به عنوان یکی از مخربترین بیماری هستتته دار ها می باشتتد این ویروس دارای ژنوم آر ان ا تک ال با یطبیت مثبت استتت و توستتتل شتتتته با رابطه ناپایا و اندام های رویشتتتی تکثیری منتقل می شتتتود ویروس لکه حلقوی گوجه فرنگی از خانواده Secoiviridae و جنس Nepovirus دارای دامنه میزبانی ب سیار و سیع ا ست و در طبیعت بی شتر بر روی گیاهان چوبی و زینتی دیده شده است این ویروس توسل نماتد بذر دانه گرده و اندام های رویشی تکثیری منتقل می شود تاکنون گزارشی از این دو ویروس در استتتان اصتتفهان وجود ندارد به منرور ردیابی این دو ویروس در استتتان اصتتفهان نمونههای برگی دارای عالیم ویروسی از نقاط مختلف استان اصفهان جمع آوری گردید از برگ های جمع آوری شده با استفاده از روش لیتیم کلرا ید Total RNA استتتتخراج شتتتتد و از ج فت آ غازگر های P1 P2 P3D P4B و 1 TORSV D1 TORSV U به منرور ردیابی ویروس آبله آلو و ویروس لکه حلقوی گوجه فرنگی در آزمون RT PCR Oligo1n Oligo2n به ترتیب استتفاده شتدند همچنین ردیابی ویروس آبله آلو در تعدادی از نمونه ها با استتفاده از روش داس الیزا DAS ELISA انجام شد در 961 نمونه بررسی شده با جفت آغازگر 1 ToRSV TORSV D1 TORSV U تنها در یک نمونه باند 400 bp و در دو نمونه نیز با جفت آغازگر Oligo1n Oligo2n باند 500 bp تکثیر شتتتدند که هیچکدام باند های مورد انترار نبودند باند های تکثیر شده تعیین توالی شدند ولی هیچکدام با توالی ویروس لکه حلقوی گوجه فرنگی موجود در بانک ژن در آزمون بال ست همولوژی ن شان ندادند در آزمون الیزا از 55 نمونه جمع آوری شده از خوان سار و نطنز ه شت نمونه از خوان سار در 313 نمونه که با جفت آغازگر های اختصاصی PPV مقایسه با کنترل مثبت آلوده به ویروس PPV تشخیص داده شدند از در آزمون RT PCR مورد برر سی یرار گرفتند تنها در پنج نمونه باند مورد انترار 243 bp با آغازگرهای 2 P1 P تکثیر شد ولی با استتتتفاده از آغازگرهای P3D P4B در هیچکدام از نمونه ها باندی تکثیر نگردید با توجه به ضتتتعیف بودن باند های تکثیر شتتده و به منرور بهینه ستتازی PCR دما و زمان مرحله اتصتتال و میزان 2 MgCl تغییر داده شتتد ولی هیچکدام تاریری چندانی در شدت باند مورد نرر نداشتند باند های مورد نرر از ژل استخراج و برای توالی یابی ارسال شدند بررسی توالیها با استفاده از نرم افزار 4 6 2 Chroms ver نشان دهنده پایین بودن کیفیت آن ها بود به همین دلیل نتایج حاصل از بالست آن ها چندان یابل اعتماد نمی باشتتتد بر استتتاس نتایج آزمون الیزا و RT PCR می توان گفت که ویروس ToRSV در این تحقیق بر روی هسته دارها در استان اصفهان تشخیص داده نشد ولی احتماال ویروس PPV در استان اصفهان بر روی هسته دار ها وجود دارد که برای تایید آن الزم استتت تا باند های تکثیر شتتده مجددا تعیین توالی شتتوند البته به دلیل وجود رابطه سترولوژیک بین پوتی ویروس ها ی مختلف احتمال وجود یک ویروس نزدیک به PPV را در استتان اصتفهان نباید از نرر دور داشت کلمات کلیدی درختان میوه هسته دار ویروس آبله آلو ویروس لکه حلقوی گوجه فرنگی الیزا RT PCR 1
چكيده انگليسي :
45 Gooding G V and Hewitt W B 1962 Grape yellow vein symptomatology Identification and the association of a mechanically transmissible virus with the disease Am J Enol Vitic 13 196 203 46 Gooding G V 1963 Purification and serology of a virus associated with the grape yellow vein disease Phytopathology 53 475 480 47 Golnaraghi A R Shahraeen N Porrahim R Farzadfar S H and Ghasemi A 2004 Occurrence and relative incidence of viruses infecting soybeans in Iran Plant Dis 88 1069 1074 48 Griffiths H M Slack S A and Dodds H J 1990 Effect of chemical and heat thrapy on virus concentration in vitro potato plantlet Can J Bot 68 1515 1521 49 Glasa M and Candresse T 2005 Partial sequence analysis of an atypical Turkish isolate provide further information on the evolutionary history of Plum pox virus PPV Virus Res 108 199 206 50 Glasa M Prichodko Y Zhivaeva T Shneider Y Predajna L Subr Z and Candresse T 2012 Complete and partial genome sequence of the unusual Plum pox virus PPV isolates from sour cherry in Russia suggest their classification to a new PPV strain in Book of Abstract International conference on virus and other Transmissible Disease of fruit crops ICVF June 3 8 2012 Rome Italy 51 Guillet I and Audergon J M 2001 Characterization of apricot cultivars infected with Plum pox potyvirus using virus concentration in leaves Acta Hort 550 107 110 52 Gumus M Paylan I C Matic S Myrta A Sipahioglu H M and Erkan s 2007 Occurrence and distribution of stone fruit viruses and viroids in commercial plantings of prunus species in western Antolia Turkey J of Plant Pathol 89 265 268 53 Hartmann W 1998 Strategy for breeding sharka resistance plums Acta Hort 478 31 35 54 Harrison B D and Murant A 1977 Nepovirus Group CMI AAB Descriptions of plant viruses 185 55 Hellen C U T Krausslich H and Wimmer E 1989 Proteolytic processing of polyproteins in the replication of RNA viruses Biochemistry 28 9881 9890 56 Hewitt W B 1954 Some virus and virus like disease of grapevines Bull the California Department of Agric 57 Isac M Preda S and Marcu M 1998 Aphid species vector of Plum pox virus Acta Virol 42 233 234 58 James D and Godkin S E 1996 Identification and differention of prunus virus isolates that cross react with Plum pox potyvirus and Apple stem pitting virus antisera Plant Dis 80 536 543 59 James D Varga A and Sanderson D 2013 Genetic diversity of plum pox virus strains disease and related challenges for control Can J Plant Pathol 35 431 441 60 John A G 1995 Detection of tomato ring spot by polymerase chain reaction Plant Dis 79 1059 1056 61 Kamran R and Izadpanah K 1981 Isolation and Identification of BYMV and ToRSV from gladiolus in Shiraz Iran J Plant Pathol 17 1 7 77
استاد راهنما :
امير مساح، صادق جلالي
استاد داور :
جهانگير خواجه علي، ابوذر سورني
