پديد آورنده :
احمدي، پريسا
عنوان :
مدلسازي مسيرTGF- β در سلول و پيشبيني اهداف مناسب دارويي
مقطع تحصيلي :
كارشناسي ارشد
محل تحصيل :
اصفهان : دانشگاه صنعتي اصفهان
صفحه شمار :
سيزده، 69ص. : مصور، جدول، نمودار
توصيفگر ها :
مسير سيگنالينگ TGF-β , فيبروز كليوي , مدلسازي , معادلات ديفرانسيل , شبيهسازي
تاريخ ورود اطلاعات :
1402/02/17
دانشكده :
مهندسي برق و كامپيوتر
تاريخ ويرايش اطلاعات :
1403/05/14
چكيده فارسي :
بيماري مزمن كليه نوعي بيماري كليوي است كه در واقع همان از دست دادن تدريجي عملكرد كليه در طول يك دوره از چند ماه تا چند سال است. تاكنون دارويي به طور خاص براي درمان بيماري مزمن كليه توليد نشده است، اما دانشمندان روشهايي را براي كنترل اين بيماري ارائه كردهاند. درمان بيماري مزمن كليه بر روي كاهش سرعت پيشروي آسيب كليوي، با كنترل عوامل ايجادكنندهي آن، تمركز دارد. بيماري مزمن كليه ممكن است در نهايت به آخرين مرحلهي نارسايي كليه منتهي شود؛ در اين وضعيت، فرد بدون انجام دياليز يا دريافت پيوند كليه جان خود را از دست خواهدداد؛ بنابراين مطالعه بر روي عواملي كه سرعت آسيب به كليه را كاهش ميدهند اهميت دارد. مسير هاي انتقال سيگنال در سلول، سلسله فرآيند هايي هستند كه طي آنها سلول با بخشهاي مختلف خودش و سلولهاي ديگر ارتباط برقرار ميكند؛ از مهم ترين مسير هاي انتقال سيگنال موجود، مسير انتقال سيگنالي به نام مسير انتقال سيگنال TGF-β است. سلولها با استفاده از مسيرهاي سيگنالي درون سلولي كه سيگنالهاي هورموني را از غشاي سلولي به هسته منتقل ميكند، محيط اطراف خود را شناسايي ميكنند. سيگنالينگ TGF-β /SMAD سلول هاي مختلف را رمزگذاري مي كند، هموستاز بافتي را كنترل مي كند و در بيماري هايي مانند سرطان و فيبروز اندام از تنظيم خارج مي شود مهمترين مشخصه در بيماريهاي مزمن كليوي، فيبروز كليوي است. شواهد حاصل از بررسي مدلهاي تجربي نشانگر اين موضوع است كه مسير انتقال سيگنال TGF-β نقش مهمي در آسيبشناسي فيبروز كليه دارد. هدف از اين پاياننامه مدلسازي مسير انتقال سيگنال TGF-β است؛ در مدلسازي مسير TGF-β، واكنشهايي كه در اين مسير به وقوع ميپيوندد توسط مجموعه اي از معادلات ديفرانسيل و با كمك قوانين كنش جرمي توصيف ميشود در نهايت پس از بهينهسازي و بدست آوردن پارامترهاي بهينه، شبيهسازي انجام ميشود و نتايج شبيهسازي با نتايج تجربي بدست آمده در آزمايشگاه مقايسه ميشود. پس از مدلسازي و تحليل رفتار اين مسير ميتوان به اين نتيجه رسيد كه نتايج تجربي مشاهده شده درست بودهاست يا به علت بروز خطا در آزمايشات به چنين نتايجي رسيدهايم علاوه بر اين ميتوان مهمترين پروتئينهاي تنظيمي مسير را شناسايي كرد و از نتايج آن براي پيشبيني هدف هاي مناسب دارويي استفاده كرد زيرا ميتواند نقش مهمي در شناسايي و درمان عارضه فيبروز كليه داشته باشد.
چكيده انگليسي :
Chronic kidney disease is a type of kidney disease that is actually the gradual loss of kidney function over a period of several months to several years. So far, no drug has been developed specifically to treat chronic kidney disease, but scientists have provided methods to control this disease. Chronic kidney disease treatment focuses on slowing down the progression of kidney damage by controlling the factors that cause it. Chronic kidney disease may eventually lead to the last stage of kidney failure; In this situation, the person will die without undergoing dialysis or receiving a kidney transplant. Therefore, it is important to investigate the factors that reduce the speed of kidney damage. Signal transmission pathways in the cell are the processes through which the cell communicates with different parts of itself and other cells. One of the most important signal transduction pathways is the TGF-β signal transduction pathway. Cells detect their surroundings using intracellular signaling pathways that transmit hormonal signals from the cell membrane to the nucleus. TGF-β/SMAD signaling encodes various cells, controls tissue homeostasis and is deregulated in diseases such as cancer and organ fibrosis. The most important characteristic in chronic kidney diseases is renal fibrosis. The evidence obtained from experimental models indicates that the TGF-β signal transmission pathway plays an important role in the pathology of kidney fibrosis. The aim of this thesis is to model the TGF-β signal transduction pathway. In the process of modeling the TGF-β pathway, the reactions that take place in this pathway are described by a set of differential equations with the help of mass action laws. Finally, after optimization and obtaining the optimal parameters, simulation is performed and the simulation results are compared with the experimental results obtained in the laboratory. After modeling and analyzing the behavior of this pathway, it can be concluded that the observed experimental results were correct or we have reached such results due to the occurrence of errors in the experiments. Finally, the most important regulatory proteins of the pathway can be identified and its results can be used to predict appropriate drug targets because it can play an important role in identifying and treating kidney fibrosis complications.
استاد راهنما :
جعفر قيصري
استاد داور :
مرضيه كمالي , احسان روحاني