18568

16144

كارشناسي ارشد

شيمي فيزيك

اصفهان : دانشگاه صنعتي اصفهان

1401

دوازده،40ص. :مصور، جدول، نمودار

1402/03/16

كتابنامه

شيمي

شيمي

1403/05/27

2926450

چكيده در محيط هاي بيولوژيكي برهمكنش DNA با يون¬هاي قليايي صورت مي¬گيرد كه باعث تغيير در ساختار الكتروني DNA مي-شود.يكي از بهترين روش ها براي مطالعه اين تغييرات ، مطالعه برهمكنش بازهاي DNA بصورت تنها با يون هاي قليايي است.تغيير در ساختار الكتروني بازهاي DNA تنها به واسطه ي اين برهمكنش را مي توان در تغيير انرژي برانگيختگي و انرژي يونش باز DNA جستجو كرد. در اين پايان نامه تاثير+Li و Li+(H2O) بر روي برانگيختگي الكتروني سيتوزين (CYT) در فاز گازي مورد مطالعه نظري قرار مي-گيرد.بدين منظور برانگيختگي الكتروني كمپلكس هاي +CYT-Li و CYT-[Li+(H2O)] در فاز گازي محاسبه شده و با مقادير متناظر مربوط به CYT تنها در فاز گازي مقايسه شده است.هم چنين منحني هاي انرژي پتانسيل پايه و دوازده حالت الكتروني برانگيخته در راستاي مختصات نرمال شيوه هاي ارتعاشي منتهي به جداشدن +Li وLi+(H2O) از گونه سيتوزين محاسبه شده است.منحني هاي انرژي پتانسيل حالات الكتروني برانگيخته با استفاده از روش تابعي چگالي وابسته به زمان (TD-DFT) و برهم كنش پيكربندي-خوشه هاي تقارن سازگار شده (SAC-CI) محاسبه¬شده اند.محاسبات بهينه سازي در حالت پايه دو ساختار متفاوت براي برهمكنش +Li و Li+(H2O) با CYT پيشنهاد نموده است.اين دو مكان عبارتند از برهمكنش همزمان +Li يا Li+(H2O) به صورت پل با گروه NH2 و N ايميني حلقه پيريميدين و يا O گروه كربونيل و N ايميني حلقه.محاسبات سطوح انرژي پتانسيل حالت برانگيخته براي هر دو ساختار به طور جداگانه صورت گرفته است و حالات برانگيخته مجاز همراه با انرژي برانگيختگي عمودي محاسبه شده است.مشاهده گرديد كه برهمكنش +Li و Li+(H2O) با CYT باعث افزايش انرژي برانگيختگي الكتروني نسبت به CYT تنها مي شود. و اين افزايش براي ساختاري كه در آن برهمكنش +Li و Li+(H2O) به طور همزمان با O كربونيل و N حلقه صورت مي گيرد، بيشتر است. كلمات كليدي: برانگيختگي الكتروني ، Li+ ،Li+(H2O) ، سيتوزين ،فاز گازي ، SAC-CI ، TD-DFT.

Abstract In biological environments, DNA interacts with alkaline ions, which causes changes in the electronic structure of DNA. One of the best ways to study these changes is to study the interaction of DNA bases only with It is alkaline ions. The change in the electronic structure of DNA bases can only be found through this interaction in the change of excitation energy and ionization energy of DNA base. In this thesis, the effect of Li+ and Li+(H2O) on the electron excitation of cytosine (CYT) in the gas phase is theoretically studied. For this purpose, the electron excitation of CYT-Li+ and CYT- [Li+(H2O)] complexes in the gas phase gas has been calculated and compared with the corresponding values related to CYT only in the gas phase. Also, the curves of the base potential energy and twelve excited electron states along the normal coordinates of the vibration modes leading to the separation of Li+ and Li+(H2O) It has been calculated from cytosine species. The potential energy curves of excited electronic states have been calculated using time-dependent density functional method (TD-DFT) and symmetry-cluster-adapted configuration interaction (SAC-CI). Optimization calculations in the ground state have proposed two different structures for the interaction of Li+ and Li+(H2O) with CYT. These two places are the simultaneous interaction of Li+ or Li+(H2O) in the form of a bridge with NH2 and N groups. Imine of the pyrimidine ring or O of the carbonyl group and N of the imine ring. The calculations of the potential energy levels of the excited state have been done separately for both structures and the allowed excited states have been calculated along with the vertical excitation energy. The interaction of Li+ and Li+(H2O) with CYT increases the electron excitation energy compared to CYT alone. And this increase is more for the structure in which the interaction of Li+ and Li+(H2O) takes place simultaneously with O carbonyl and N of the ring. Key words: electron excitation, Li+, Li+(H2O), cytosine, gas phase, SAC-CI, TD- FT.

حسين فرخ پور

كيامرث اسكندري

محمدمحسن مومني هامانه , عليرضا نجفي چرمهيني