شماره مدرك :
19966
شماره راهنما :
17239
پديد آورنده :
واعظ، زينب
عنوان :

مطالعه ژن ها و مناطق كروموزومي شناسايي شده مسئول براي صفات عملكردي و توليد مثلي در گوسفند: فراتحليل پويش كل ژنوم

مقطع تحصيلي :
كارشناسي ارشد
گرايش تحصيلي :
ژنتيك و اصلاح نژاددام و طيور
محل تحصيل :
اصفهان : دانشگاه صنعتي اصفهان
سال دفاع :
1403
صفحه شمار :
يازده،،59 ص: مصور
توصيفگر ها :
ژن , كروموزوم , شير , وزن بدن , توليد مثل , افزايش وزن بدن
تاريخ ورود اطلاعات :
1403/09/04
كتابنامه :
كتابنامه
رشته تحصيلي :
مهندسي كشاورزي- علوم دامي
دانشكده :
مهندسي كشاورزي
تاريخ ويرايش اطلاعات :
1403/09/05
كد ايرانداك :
23090436
چكيده فارسي :
به منظور بررسي ژن¬ها و مناطق كروموزومي شناسايي شده مسئول صفات عملكرد توليد مثلي در گوسفند، مطالعه¬ فراتحليلي پويش كل ژنوم انجام شد. بدين منظور با استفاده از كليد واژه¬هاي فارسي و معادل لاتين آن¬ها از جمله ژن، كروموزوم، SNP، GWAS، مناطق كروموزمي، گوسفند، صفات عملكردي و صفات توليد مثلي در پايگاه¬هاي انگليسي زباني PubMed، Scopus، Web of Science و Google Scholar و فارسي زبان Irandoc، SID، Magiran و Civilica مقالات مورد نظر استخراج و سپس وارد نرم افزار اندنوت گرديد. پس از حذف مقالات تكراري و مقالات فاقد اطلاعات مورد نظر، در نهايت 35 مطالعه وارد نرم افزار R نسخه 1.4.4 گرديد. به منظور تجزيه و تحليل داده¬هاي به دست آمده از بسته metafor و qqman استفاده شد. نمودار صفات گروه وزن در اين مطالعه نشان داد كه بيشترين تعداد اسنيپ ابتدا بر روي كروموزوم 6 و بعد از آن كروموزوم X و بعد از آن بر روي كروموزوم 3 قرار دارد و كمترين اسنيپ¬هاي مشاهده شده بر روي كروموزوم 24 است. نمودار صفات گروه توليد مثل نشان داد كه بيشترين تعداد اسنيپ ابتدا بر روي كروموزوم 1 و بعد از آن كروموزوم 2 و 3 قرار دارد. همچنين كمترين تعداد اسنيپ در اين گروه بر روي كروموزوم 16 قرار داشت. بيشترين تعداد اسنيپ¬ها براي صفات گروه شيردهي ابتدا بر روي كروموزوم 2 و سپس شماره 1 و بعد از آن شماره 3 قرار دارد. همچنين كمترين تعداد اسنيپ¬ها بر روي كروموزوم 23 مشاهده گرديد. نتايج مربوط به منهتن پلات براي صفت وزن تولد چهار اسنيپ OAR2_51716542.1، OAR12_20575087.1 ،OAR17_29260298.1 و s03219.1 را معني¬دار نشان دادند كه به ترتيب بر روي كروموزوم¬هاي 2، 12، 17و18 قرار داشت. براي صفت وزن از شيرگيري دو اسنيپ rs421690996 و rs409558668 كه به ترتيب بر روي كروموزوم¬هاي 22 و 16 قرار داشتند معني¬دار مشاهده گرديدند. براي صفت افزايش وزن روزانه قبل از شيرگيري اسنيپ OAR10_91128145.1 كه بر روي كرموزوم 10 قرار داشت معني¬دار اما براي افزايش وزن روزانه پس از شيرگيري اسنيپ معني¬داري مشاهده نگرديد. براي صفت افزايش وزن روزانه و وزن صفت بدن اسنيپ rs414911966 و s45224.1 كه به ترتيب بر روي كروموزوم 20 و 1 قرار داشتند معني¬دار مشاهده گرديد. همچنين براي وزن يك¬سالگي اسنيپ¬هاي OAR6_27552838.1، OAR8_39977285.1، OAR5_84496122_X.1، oar3_OAR9_42035112، oar3_OAR20_22070146 و s12060.1 كه بر روي كروموزوم¬هاي 6، 8، 5، 9، 20 و1 قرار داشتند معني¬دار مشاهده گرديدند. براي صفت توليد مثلي اندازه بره متولد شده اسنيپ s50067.1 واقع بر روي كروموزوم 2 و براي صفت دو قلوزايي اسنيپ OAR3_233748114.1 واقع بر روي كروموزوم 3 معني¬دار شد. براي صفات توليد و تركيبات شير از جمله درصد پروتئين و مقدار چربي اسنيپ معني داري مشاهده نشد اما براي صفت درصد چربي دو اسنيپ rs425417915 و OAR3_147028849 كه به ترتيب بر روي كروموزوم¬هاي 7 و 3 واقع قرار داشتند معني¬دار بودند.
چكيده انگليسي :
A meta-analysis of genome-wide association studies (GWAS) was conducted to identify genes and chromosomal regions associated with reproductive performance traits in sheep. Using Persian and English keywords such as gene, chromosome, SNP, GWAS, chromosomal regions, sheep, performance traits, and reproductive traits, relevant articles were retrieved from English databases including PubMed, Scopus, Web of Science, and Google Scholar, as well as Persian databases such as Irandoc, SID, Magiran, and Civilica. After removing duplicates and irrelevant articles, a total of 35 studies were included in R version 4.4.1. The metafor and qqman packages were used to analyze the data. The results showed that for weight traits, the highest number of SNPs was located on chromosome 6, followed by chromosome X and then chromosome 3, with the lowest number of SNPs observed on chromosome 24. For reproductive traits, the highest number of SNPs was located on chromosomes 1, 2, and 3, with the lowest number on chromosome 16. For lactation traits, the highest number of SNPs was located on chromosomes 2, 1, and 3, with the lowest number on chromosome 23. Manhattan plots for birth weight identified four significant SNPs: OAR2_51716542.1, OAR12_20575087.1, OAR17_29260298.1, and s03219.1, located on chromosomes 2, 12, 17, and 18, respectively. For weaning weight, two significant SNPs were identified: rs421690996 and rs409558668, located on chromosomes 22 and 16, respectively. For average daily gain before weaning, SNP OAR10_91128145.1 on chromosome 10 was significant, but no significant SNPs were found for average daily gain after weaning. For average daily gain and body weight, SNPs rs414911966 and s45224.1, located on chromosomes 20 and 1, respectively, were significant. For yearling weight, SNPs OAR6_27552838.1, OAR8_39977285.1, OAR5_84496122_X.1, oar3_OAR9_42035112, oar3_OAR20_22070146, and s12060.1, located on chromosomes 6, 8, 5, 9, 20, and 1, respectively, were significant. For the reproductive trait of lamb birth weight, SNP s50067.1 on chromosome 2 was significant, and for the trait of twinning, SNP OAR3_233748114.1 on chromosome 3 was significant. No significant SNPs were found for milk production traits and milk components, except for milk fat percentage, where two SNPs, rs425417915 and OAR3_147028849, located on chromosomes 7 and 3, respectively, were significant.
استاد راهنما :
سعيد انصاري مهياري
استاد مشاور :
مريم السادات شاه اميري
استاد داور :
اميرحسين مهدوي , مجيد طالبي
لينک به اين مدرک :

بازگشت