توصيفگر ها :
كاندونگا , بيماري زايي , ژنتيك جمعيت , رانش ژنتيكي , ترانسپوزون ها
چكيده فارسي :
گونههاي مختلف Botrytis باعث بيماري كپك خاكستري و لكهبرگي در طيف وسيعي از گياهان زراعي و زينتي غيرتجاري و تجاري (مانند گل رز و توت فرنگي) مي‌شوند. برخي از گياهان مانند تمشك وحشي، كه به طور بالقوه به عنوان يك ميزبان واسط عمل مي‌كند، مي‌تواند نقش مهمي در پراكنش بيماري داشته باشد. در اين مطالعه، جدايه‌هاي بسياري متعلق به جنس‌هاي مختلف، از تمشك، گل رز و توت‌فرنگي از استان‌هاي مختلف ايران جمع‌آوري شد. بررسي ريخت‌شناختي (ماكروسكوپي و ميكروسكوپي) وجود 389 جدايه Botrytis در بين تمام جدايه‌ها را نشان داد. از آنجا كه بسياري از گونه‌ها قادر خواهند بود تمامي گياهان نمونه‌برداري‌شده را آلوده كنند، 60 جدايه پس از تعيين هاپلوتيپ با استفاده از گروه‌بندي مولكولي (بر اساس TEs، ژنهاي cytb و mrr1، همراه با پاسخ قارچ‌كش)، انتخاب و در ابتدا بر اساس ژن rpb2 شناسايي شدند. پس از آن، 16 جدايه (يك نمونه از هر كلاد) با استفاده از ژنهاي g3pdh، hsp60 و nep2 مورد بررسي بيشتر قرار گرفتند. نتايج نشان داد كه سه گونه مجزا، B. cinerea، B. sinoviticola و B. prunorum در بين جدايه‌ها وجود دارد. همچنين جدايه‌هاي متعلق به Botrytis group S براي اولين بار در ايران شناسايي شدند. همچنين، در اين مطالعه شناسايي گونۀ B. sinoviticola از توت‌فرنگي ايراني براي اولين بار گزارش مي‌شود. مطالعۀ ايديومورف تيپ آميزشي، وجود هر دو آلل (45% تا 56%) را در بين جدايه‌هاي مورد بررسي نشان داد. سطوح مختلف پرآزاري در هر دو ميزبان توت‌فرنگي (رقم كاندونگا) و خيار (رقم نيمهبلند پولينيانو) مشاهده شد. استفادۀ گسترده از قارچ‌كش‌ها در ايران را مي‌توان دليل اصلي تشخيص تعداد بالاي ايزوله‌هاي مقاوم به كليۀ قارچ‌كش‌هاي مورد استفاده (Iso, Bos, Tri, Pyr, Fen, Flu) دانست. بالاترين نسبت جدايه‌هاي مقاوم (82%) متعلق به Tri، به دليل استفادۀ زياد از آزوكسي استروبين (با نحوۀ اثر مشابه) در ايران بود. مطالعۀ ژنتيك جمعيت 180 جدايه (30 جدايه B. cinerea از هر جمعيت از توت‌فرنگي) با هفت نشانگر SSR، جدايه‌ها را در سه كلاد، بدون ارتباط با محل نمونه‌برداري، قرار داد. نتايج حاصل از تجزيه و تحليل ساختار، دو خزانۀ ژني را در بين جدايه‌ها نشان داد. از نظر آماري، اگرچه توزيع برخي از ويژگي‌ها نرمال بود، اما هيچ همبستگي مثبتي بين ويژگي‌هاي مولكولي، زمان/محل نمونه‌برداري، ميزبان، پرآزاري، پاسخ به قارچ‌كش و گروه‌بندي ژنتيكي جمعيت مشاهده نشد.
چكيده انگليسي :
Various Botrytis species cause gray mold disease and leaf blight in a wide range of wild and domesticated crop plants (including rose and strawberries). Some plants, such as wild raspberry, which potentially serving as intermediate hosts, can play an important role in disease distribution. In this study, many isolates belonging to different genera were collected from raspberries, roses, and strawberries in different provinces of Iran. Morphological studies (macroscopic and microscopic) revealed the presence of 389 Botrytis isolates. As many species could infect all sampled plants, following haplotyping using molecular grouping (based on TEs, cytb, and mrr1 genes along with fungicide response), firstly 60 isolates were selected and identified based on the rpb2 gene. Subsequently, 16 isolates (one from each clade) were further characterized using the g3pdh, hsp60, and nep2 genes. The results revealed the presence of three distinct species, B. cinerea, B. sinoviticola, and B. prunorum, among our isolates. Additionally, isolates belonging to the Botrytis group S were identified for the first time in Iran. Notably, this study also documented for the first time the identification of B. sinoviticola from Iranian strawberries. It should be noted that all possible situations related to molecular markers were observed. The mating type study showed the presence of both alleles (45–56%) among the collected Botrytis isolates. Different levels of virulence were detected in both examined plants (strawberry (cv. Condunga), and cucumber (cv. Midlung polygnano) were also detected. Wide fungicide use in Iran can be considered the main reason for the high number of isolates resistant to all fungicides used (isofetamid, boscalid, pyrimethanil, trifloxystrobin, fenexamid, and fludioxonil). The highest proportion of resistant isolates (82%) belonged to Tri because of the many uses of azoxystrobin (with the same mode of action). A population genetics study of 180 isolates (30 B. cinerea isolates from each population collected from strawberries) by seven SSR markers placed isolates in tree-separated clades, with no correlation to the sampling location. Structural analysis revealed two gene pools in the isolates. From a statistical perspective, although the distribution of some features was normal, no positive correlation was obtained among the molecular features, sampling time/location, host, virulence, fungicide response, and population genetic grouping.
