پديد آورنده :
دوستي، مريم
عنوان :
شناسايي و توالي يابي ژن هاي لينالول سينتاز و اوژنول سينتاز در رز (Rosa hybrida) و گل محمدي (R. damascena)
مقطع تحصيلي :
كارشناسي ارشد
گرايش تحصيلي :
بيوتكنولوژي
محل تحصيل :
اصفهان: دانشگاه صنعتي اصفهان، دانشكده كشاورزي
صفحه شمار :
پانزده،94ص.: مصور،جدول،نمودار(رنگي)
يادداشت :
ص.ع.به فارسي و انگليسي
استاد راهنما :
مجيد طالبي، بدرالدين ابراهيم سيد طباطبايي
استاد مشاور :
نعمت اله اعتمادي
توصيفگر ها :
تركيبات معطر , lis , egs , gds
تاريخ نمايه سازي :
16/2/93
استاد داور :
بهرام شريف نبي، مهدي رحيم ملك
چكيده فارسي :
1 چكيده رز از مهمترين گياهان زينتي و معطر دنيا محسوب ميشود و به دليل دارا بودن تركيبات معطر كاربردهاي فراوان در صنايع غذايي داروسازي آرايشي بهداشتي و عطرسازي دارد عطر گل رز متشكل از بيش از 115 تركيب مختلف است كه متعلق به سه گروه ترپنوئيدها فنيل پروپانوئيدها و مشتقات اسيد چرب ميباشند مطالعه تفاوت ژنهاي بيان شده در رزهاي معطر و غير معطر منجر به شناسايي چندين ژن كد كننده آنزيمهاي دخيل در سنتز مواد معطر فرار شد اسانس رز از ارزشمندترين اسانسها ميباشد و فرآيند توليدآن طوالني پيچيده وكم بازده است بنابراين شناسايي و رديابي ژنهاي دخيل در سنتز تركيبات معطر جهت بهبود كيفيت اسانس و افزايش توليد آن در جنس رز ضروري بنظر ميرسد به همين منظور در اين پژوهش سه ژن دخيل در مسير سنتز تركيبات معطر شامل دو ژن لينالول سينتاز lis و جرماكرين دي سينتاز gds متعلق به گروه ترپنوئيدها و ژن اوژنول سينتاز egs متعلق به گروه فنيل پروپانوئيدها مورد بررسي قرار گرفت در اين مطالعه ابتدا همرديف سازي تواليهاي پروتئيني و توالي نوكلئوتيدي متناظر با آنها مربوط به سه ژن مذكور در خانوادههاي مختلف گياهي صورت گرفت و بر اساس نواحي با بيشترين شباهت آغازگرهاي اختصاصي طراحي شد و تكثير آن ها در سه گونه R canina Rosa hybrida و R damascena بررسي گرديد آغازگرهاي مربوط به ژن lis قطعاتي با طول تقريبي 154 و 1112 جفت نوكلئوتيد و آغازگرهاي مربوط به ژن egs نيز قطعاتي با طول 1122 و 1112 در سه گونه مذكور تكثير كردند تكثير قطعات 1191 و 1111 جفت نوكلئوتيدي نيز در دو گونه R hybrida و R damascena با استفاده از آغازگرهاي اختصاصي ژن gds انجام گرفت نتايج حاصل از جستجو با ابزار BLAST در پايگاه اطالعاتي NCBI و همچنين همرديف سازي چند تايي براي توالي نوكلئوتيدي و آمينواسيدي مربوط به ژنهاي egs lis و gds با تواليهاي همتاي خود در ساير گياهان موجود در پايگاه اطالعاتي NCBI براي تواليهاي بدست آمده صحت تواليهاي مذكور را تأييد نمود بررسي تنوع از طريق محاسبه ميانگين Pairwise distance بر مبناي مدل K2P و P distance و همچنين درصد تنوع بر مبناي جايگزيني همجنس و ناهمجنس بين گونههاي مورد مطالعه و ديگر خانوادههاي گياهي براي سه ژن مذكور صورت گرفت محاسبه Pairwise distance بر اساس مدل K2P براي دو ژن lis و egs نشان داد كه دو گونه R damascena و R canina فاصله كمتري با يكديگر دارند و R hybrida داراي تنوع بيشتري با دو گونه ديگر است با توجه به اينكه كه رز هيبريد از رزهاي مدرن محسوب ميشود و در اثر تالقي بين گونههاي قديمي و وقوع جهش كراسينگاور و گزينش بيشتر دستخوش تغييرات بوده بنابراين تنوع بيشتري را با رزهاي قديمي و وحشي نشان ميدهد داده هاي حاصل از محاسبه ميانگين كل بر مبناي مدل k2P و P distance براي ژنهاي 0 115 lis 1 921 gds 1 152 egs و در صد تنوع بر اساس جايگزيني هم جنس و ناهمجنس 13 2 egs 2 11 lis و 52 12 gds نشان داد كه بيشترين تنوع مربوط به ژن gds ميباشد و جنسهاي خانواده Rosaceae از نظر ژن egs حفاظت شدگي بيشتري دارند طبق خوشه بندي حاصل از ترسيم نمودار فيلوژني بر اساس ضريب Maximum parsimony براي هرسه ژن مذكور جنسهاي خانواده Rosaceae در كنار يكديگر گروه بندي شدند و نتايج حاصل از گروهبندي براي ژنهاي lis و egs با نتايج حاصل از گروه بندي جنسهاي خانواده Rosaceae بر اساس ژنهاي كلروپالستي همسو بود و اين نشان دهنده شباهت بيشتر جنسهاي خانواده گل سرخيان از نظرژنهاي lis و egs ميباشد كلمات كليدي رز تركيبات معطر gds egs lis
چكيده انگليسي :
Identification and Sequencing of Linalool Synthase and Eugenol Synthase Genes in Rosa hybrida and R damascena Maryam Dousti m dousti@ag iut ac ir January 11 2014 Department of Agricultural Biotechnology Isfahan University of Technology Isfahan 84156 83111 IranDegree M Sc Language FarsiM Talebi Assist Prof mtalebi@cc iut ac irB E Sayed Tabatabaei Prof sayedt@cc iut ac irAbstractRose is one of the most aromatic and ornamental plant crops worldwide and due to aromatic compoundshave many uses in the food pharmacy cosmetics and perfume industry Rose scent are composed ofmore than 500 different compounds that belong to three groups terpenoids phenylpropanoids and fattyacid derivatives Studies of differences in gene expression between scented and non scented roses haveled to the identi cation of several genes encoding enzymes involved in the biosynthesis of scent volatiles Rose essential oil is one of the valuable oils and its production process is time consuming complicatedand less efficient Therefore identification and detection of genes involved in the synthesis of aromaticcompounds is necessary to improve the quality and increase oil production in Rose genus In this researchthree genes involved in the biosynthetic pathway of aromatic compounds including two terpenoid genes linalool synthase lis and germacrene synthase gds and phenylpropanoid gene eugenol synthase egs were investigated Firstly multiple alignment of DNA and protein sequences of these genes wereperformed in different plant families Specific primers were designed based on conserved sequences ofthe genes and amplified in three Rosa species R hybrida R damascena and R canina using PCR Twolis primer pairs amplified 450 and 1000 bp fragments and two egs primer pairs amplified 1100 and 1200bp fragmens in the species Two gds primer pairs amplified 2000 and 2300 bp fragments in R hybridaand R damascena BLAST search of nocleotide and protein sequences of the genes in NCBI database andmultiple sequence alignments confirmed the sequence of the genes The mean of paiwise distance basedon K2P and P distance models and genetic diversity based on transition and transvertion among thespecies and other plant families were calculated Pairwise distance based on K2P model for lis and egsgenes indicated the close relationships of two species R damascena and R canina and R hybrida wasmore diverse than R damascena and R canina R hybrida is a modern rose and possibly generated bycrossing between species of the old and mutation crossing over and selection among modern roses thatmight change it s geno e co osition therefore ore diversity is e ected ith old and ild rosespeciese Average K2P and P distance models for lis 0 085 egs 0 051 and gds 0 317 genes andgenetic diversity based on transition and transvertion lis 1 97 egs 1 27 gds 10 15 showed the mostvariation is related to gds gene and genera of the Rosaceae family are more conserved for egs than othergenes The clustere analysis based on Maximum parsimony coefficient for three genes grouped the genusof Rosaceae family The results of lis and egs genes phylogeny confirmed the previous Rosaceaechloroplast gene phylogeny which indicated the concordance of this phylogenetical analysis and this isindicated the similarity of different genera in rosaceae family based on lis and egs genes Keywords Rose Aromatic compound lis egs gds
استاد راهنما :
مجيد طالبي، بدرالدين ابراهيم سيد طباطبايي
استاد مشاور :
نعمت اله اعتمادي
استاد داور :
بهرام شريف نبي، مهدي رحيم ملك
